More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_17351 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  85.46 
 
 		 399 aa  708    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  85.46 
 
 		 399 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  100 
 
 		 399 aa  821    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  71.68 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  50.5 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  49.75 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  49.87 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  48.14 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  46.03 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  44.41 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  41.29 
 
 		 406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  43.47 
 
 		 395 aa  325  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  40.64 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  41.71 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  41.71 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  42.02 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  41.6 
 
 		 395 aa  309  5.9999999999999995e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  38.5 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  36.59 
 
 		 379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  34.48 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  37.57 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  35.41 
 
 		 373 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  35.62 
 
 		 389 aa  229  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  36.24 
 
 		 380 aa  227  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  36.8 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  37 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  34.65 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  34.58 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  34.55 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  34.49 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  32.72 
 
 		 390 aa  222  8e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  35.12 
 
 		 379 aa  222  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  35.14 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  34.41 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  34.52 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  33.87 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  32.72 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  33.42 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  35.22 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  33.51 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  32.82 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  34.68 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  33.33 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  31.4 
 
 		 390 aa  217  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  35.45 
 
 		 390 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  35.52 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  35.52 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  35.52 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  33.07 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  32.26 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  34.46 
 
 		 370 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  35.83 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  32.88 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  33.16 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  35.05 
 
 		 408 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  33.16 
 
 		 370 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  35.83 
 
 		 391 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  35.56 
 
 		 391 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  33.52 
 
 		 371 aa  209  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  35.56 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  35.54 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  32.19 
 
 		 377 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  35.28 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  30.08 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  34.22 
 
 		 386 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  31.18 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  34.32 
 
 		 391 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  34.32 
 
 		 391 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  31.18 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  33.96 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  29.81 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  32.45 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  33.61 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  32.45 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  35.03 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  35.45 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  35.01 
 
 		 408 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  32.79 
 
 		 378 aa  202  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  34.86 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  30.16 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  32.11 
 
 		 851 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  35.68 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  35.19 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  32.88 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  35.09 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  34.25 
 
 		 366 aa  199  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  34.57 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  34.57 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  34.57 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  34.57 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  34.57 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  34.57 
 
 		 389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  33.42 
 
 		 378 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  29.97 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  31.84 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  34.31 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  32.89 
 
 		 380 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  32.4 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  33.51 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1028  alanine racemase  34.84 
 
 		 368 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>