85 genes were found for organism Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ajs_4163  CDS  NC_008765  64  324  -  261  hypothetical protein  YP_973999  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4164  CDS  NC_008765  332  1057  -  726  peptidase M48, Ste24p  YP_974000  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4165  CDS  NC_008765  1133  1516  -  384  hypothetical protein  YP_974001  normal  1  normal  0.817101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4166  CDS  NC_008765  1546  1800  +  255  hypothetical protein  YP_974002  normal  1  normal  0.588545  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4167  CDS  NC_008765  2127  5174  -  3048  TraG domain-containing protein  YP_974003  normal  1  normal  0.554072  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4168  CDS  NC_008765  5186  6592  -  1407  TraH family protein  YP_974004  normal  1  normal  0.391423  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4169  CDS  NC_008765  6603  7415  -  813  hypothetical protein  YP_974005  normal  1  normal  0.347848  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4170  CDS  NC_008765  7420  7782  -  363  hypothetical protein  YP_974006  normal  1  normal  0.319985  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4171  CDS  NC_008765  7779  9023  -  1245  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  YP_974007  normal  1  normal  0.366159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4172  CDS  NC_008765  9020  10318  -  1299  hypothetical protein  YP_974008  normal  1  normal  0.109495  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4173  CDS  NC_008765  10315  11091  -  777  hypothetical protein  YP_974009  normal  1  normal  0.0999993  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4174  CDS  NC_008765  11091  12092  -  1002  TraU family protein  YP_974010  normal  1  normal  0.109495  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4175  CDS  NC_008765  12089  12727  -  639  hypothetical protein  YP_974011  normal  1  normal  0.0943876  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4176  CDS  NC_008765  12714  13190  -  477  hypothetical protein  YP_974012  normal  1  normal  0.0912221  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4177  CDS  NC_008765  13190  13618  -  429  hypothetical protein  YP_974013  normal  1  normal  0.0294683  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4178  CDS  NC_008765  13608  16232  -  2625  hypothetical protein  YP_974014  normal  1  normal  0.0161122  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4179  CDS  NC_008765  16270  16920  -  651  membrane lipoprotein lipid attachment site  YP_974015  normal  0.51948  hitchhiker  0.00159684  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4180  CDS  NC_008765  17063  17812  -  750  protein-disulfide isomerase  YP_974016  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4181  CDS  NC_008765  17805  19154  -  1350  TraB pilus assembly family protein  YP_974017  hitchhiker  0.000413656  hitchhiker  0.000231943  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4182  CDS  NC_008765  19147  19884  -  738  hypothetical protein  YP_974018  decreased coverage  0.0000230688  hitchhiker  0.0000485707  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4183  CDS  NC_008765  19820  20413  -  594  hypothetical protein  YP_974019  decreased coverage  0.0000132578  hitchhiker  0.0000422379  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4184  CDS  NC_008765  20428  20721  -  294  hypothetical protein  YP_974020  hitchhiker  0.000011199  hitchhiker  0.0000372999  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4185  CDS  NC_008765  20737  21069  -  333  hypothetical protein  YP_974021  hitchhiker  0.0000474066  hitchhiker  0.0000390801  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4186  CDS  NC_008765  21164  21547  -  384  hypothetical protein  YP_974022  hitchhiker  0.0000611315  decreased coverage  0.00000952948  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4187  CDS  NC_008765  21549  22049  -  501  lytic transglycosylase, catalytic  YP_974023  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4188  CDS  NC_008765  22495  23154  +  660  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_974024  normal  0.141234  hitchhiker  0.000181264  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4189  CDS  NC_008765  23123  24091  -  969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_974025  normal  0.122889  hitchhiker  0.0000562905  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4190  CDS  NC_008765  24100  24375  -  276  hypothetical protein  YP_974026  normal  1  hitchhiker  0.0000445922  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4191  CDS  NC_008765  24409  25263  -  855  hypothetical protein  YP_974027  normal  1  hitchhiker  0.0000545617  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4192  CDS  NC_008765  25708  28593  -  2886  TrwC protein  YP_974028  normal  1  hitchhiker  0.000135476  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4193  CDS  NC_008765  28590  29045  -  456  putative thiol:disulfide interchange transmembrane protein  YP_974029  normal  1  hitchhiker  0.00678972  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4194  CDS  NC_008765  29057  31054  -  1998  hypothetical protein  YP_974030  normal  1  normal  0.0224168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4195  CDS  NC_008765  31056  31433  -  378  hypothetical protein  YP_974031  normal  1  normal  0.0882192  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4196  CDS  NC_008765  31746  32066  +  321  hypothetical protein  YP_974032  normal  1  normal  0.143474  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4197  CDS  NC_008765  32587  32880  +  294  hypothetical protein  YP_974033  normal  1  normal  0.14577  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4198  CDS  NC_008765  33517  34134  -  618  resolvase domain-containing protein  YP_974034  normal  1  normal  0.163134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4199  CDS  NC_008765  34142  34378  -  237  hypothetical protein  YP_974035  normal  1  normal  0.216394  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4200  CDS  NC_008765  34391  34717  -  327  hypothetical protein  YP_974036  normal  1  normal  0.221482  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4201  CDS  NC_008765  34732  35061  -  330  hypothetical protein  YP_974037  normal  1  normal  0.2102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4202  CDS  NC_008765  35234  35728  -  495  DNA repair protein RadC  YP_974038  normal  1  normal  0.21413  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4203  CDS  NC_008765  36284  36502  -  219  hypothetical protein  YP_974039  normal  0.524161  normal  0.421301  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4204  CDS  NC_008765  36546  36995  -  450  hypothetical protein  YP_974040  normal  0.0213962  normal  0.432485  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4205  CDS  NC_008765  37009  37476  -  468  hypothetical protein  YP_974041  normal  0.0345177  normal  0.602595  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4206  CDS  NC_008765  37530  39506  -  1977  methyltransferase type 11  YP_974042  hitchhiker  0.00000155925  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4207  CDS  NC_008765  40603  40830  -  228  hypothetical protein  YP_974043  hitchhiker  0.0000000416104  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4208  CDS  NC_008765  40939  41244  -  306  hypothetical protein  YP_974044  hitchhiker  0.0000000900898  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4209  CDS  NC_008765  41280  41621  -  342  hypothetical protein  YP_974045  hitchhiker  0.000000100106  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4210  CDS  NC_008765  41691  42515  -  825  hypothetical protein  YP_974046  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4211  CDS  NC_008765  42604  43035  -  432  single-strand binding protein  YP_974047  hitchhiker  0.00000000040739  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4212  CDS  NC_008765  43800  44351  -  552  hypothetical protein  YP_974048  hitchhiker  0.00000000703087  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4213  CDS  NC_008765  44370  44987  -  618  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  YP_974049  hitchhiker  0.00000010604  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4214  CDS  NC_008765  45009  45923  -  915  C-5 cytosine-specific DNA methylase  YP_974050  hitchhiker  0.0000361487  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4215  CDS  NC_008765  45928  46149  -  222  hypothetical protein  YP_974051  hitchhiker  0.0000137335  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4216  CDS  NC_008765  46360  46860  -  501  hypothetical protein  YP_974052  normal  0.150623  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4217  CDS  NC_008765  46857  47765  -  909  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  YP_974053  normal  0.77511  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4218  CDS  NC_008765  47762  48805  -  1044  hypothetical protein  YP_974054  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4219  CDS  NC_008765  50359  51294  -  936  hypothetical protein  YP_974055  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4220  CDS  NC_008765  51494  51808  -  315  putative transcriptional regulator  YP_974056  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4221  CDS  NC_008765  51805  52128  -  324  hypothetical protein  YP_974057  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4222  CDS  NC_008765  52202  52600  -  399  hypothetical protein  YP_974058  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4223  CDS  NC_008765  52662  53954  -  1293  parB-like partition proteins  YP_974059  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4224  CDS  NC_008765  53967  54749  -  783  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_974060  normal  0.323869  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4225  CDS  NC_008765  54778  55197  -  420  hypothetical protein  YP_974061  normal  0.016035  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4226    NC_008765  55353  56339  -  987      decreased coverage  0.00338168  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4227  CDS  NC_008765  56343  56606  -  264  hypothetical protein  YP_974062  normal  0.0215975  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4228  CDS  NC_008765  56797  59712  +  2916  transposase Tn3 family protein  YP_974063  normal  0.260644  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4229  CDS  NC_008765  59806  60255  +  450  hypothetical protein  YP_974064  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4230  CDS  NC_008765  60495  61157  -  663  metal dependent phosphohydrolase  YP_974065  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4231  CDS  NC_008765  61154  61681  -  528  aspartyl protease-like protein  YP_974066  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4232  CDS  NC_008765  61678  62418  -  741  hypothetical protein  YP_974067  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4233  CDS  NC_008765  62466  63089  -  624  NERD domain-containing protein  YP_974068  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4234  CDS  NC_008765  63107  63808  -  702  hypothetical protein  YP_974069  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4235  CDS  NC_008765  63818  64861  -  1044  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_974070  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4236  CDS  NC_008765  64865  65140  -  276  histone family protein DNA-binding protein  YP_974071  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4237  CDS  NC_008765  65296  65820  -  525  hypothetical protein  YP_974072  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4238  CDS  NC_008765  65817  67028  -  1212  hypothetical protein  YP_974073  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4239  CDS  NC_008765  67044  68726  -  1683  zeta toxin family protein  YP_974074  normal  0.906511  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4240  CDS  NC_008765  68744  69004  -  261  hypothetical protein  YP_974075  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4241  CDS  NC_008765  69018  69479  -  462  hypothetical protein  YP_974076  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4242  CDS  NC_008765  69512  70600  -  1089  filamentation induced by cAMP protein Fic  YP_974077  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4243  CDS  NC_008765  70597  70824  -  228  hypothetical protein  YP_974078  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4244  CDS  NC_008765  70837  71100  -  264  hypothetical protein  YP_974079  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4245  CDS  NC_008765  71328  71576  -  249  hypothetical protein  YP_974080  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4246  CDS  NC_008765  71600  72124  -  525  hypothetical protein  YP_974081  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_4247  CDS  NC_008765  72121  72534  -  414  hypothetical protein  YP_974082  normal  1  normal  1  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>