20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4239 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008765  Ajs_4239  zeta toxin family protein  100 
 
 
560 aa  1136    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906511  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6819  zeta toxin family protein  52.61 
 
 
659 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  55.73 
 
 
362 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4336  zeta toxin  36.32 
 
 
586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6379  zeta toxin family protein  31.25 
 
 
383 aa  127  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5016  zeta toxin family protein  34.31 
 
 
365 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0360  Zeta toxin family protein  30.96 
 
 
270 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0194178  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2358  zeta toxin  27.76 
 
 
350 aa  100  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519166  normal  0.533429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0420  Sigma 54 interacting domain protein  28.19 
 
 
256 aa  98.2  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.482221  hitchhiker  0.00000000444623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4262  putative zeta toxin  28.65 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.484373  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4571  putative zeta toxin  28.65 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4193  Zeta toxin family protein  28.81 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0158  zeta toxin superfamily protein  28 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00432306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2837  hypothetical protein  27.36 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2841  zeta toxin  26.16 
 
 
450 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21799 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47232  predicted protein  27.06 
 
 
492 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.714654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0565  zeta toxin family protein  23.97 
 
 
326 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.815092  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0914  Zeta toxin family protein  25.51 
 
 
149 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3339  hypothetical protein  34.67 
 
 
77 aa  50.8  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.017033  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0531  hypothetical protein  23.14 
 
 
367 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>