22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4183 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4183  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000132578  hitchhiker  0.0000422379 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6792  hypothetical protein  40.64 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2648  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  27.87 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2315  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  27.87 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1540  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  31.16 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.475003  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0037  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  30.56 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0075  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  25.32 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0016  hypothetical protein  26.58 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.813355  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2157  hypothetical protein  27.06 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0257  putative sex pilus assembly and synthesis protein  22.45 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.788798  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4446  TraE family protein  18.99 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.622638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4631  type IV conjugative transfer system protein TraE  20.56 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.802184 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4539  type IV conjugative transfer system protein TraE  21.01 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.369103  normal  0.416907 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4374  type IV conjugative transfer system protein TraE  21.01 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4498  type IV conjugative transfer system protein TraE  21.01 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4442  type IV conjugative transfer system protein TraE  21.01 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_04  conjugative transfer protein TraE  22.88 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0320  conserved hypothetical sex pilus assembly and synthesis protein  23.13 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0024  hypothetical protein  23.2 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0930  putative conjugative transfer protein TraE  26.53 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0844234  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0074  type IV conjugative transfer system protein TraE  24.86 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3781  putative sex pilus assembly and synthesis protein  23.6 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.271719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>