75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4191 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4191  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000545617 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3785  YheO domain-containing protein  32.23 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  0.997739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  33.58 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  34.38 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  35.59 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4371  hypothetical protein  34.86 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0153  YheO domain-containing protein  32.77 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3127  YheO domain protein  32.77 
 
 		 218 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04794  hypothetical protein  31.93 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5755  YheO domain-containing protein  31.93 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00241536  hitchhiker  0.000000000000540056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4823  hypothetical protein  29.68 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00729669  normal  0.42509 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4178  YheO domain-containing protein  30.08 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4112  YheO domain protein  31.4 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3999  YheO domain protein  31.4 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2566  YheO domain protein  28.91 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.086205  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3881  YheO domain-containing protein  30.51 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0788485 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5858  YheO domain-containing protein  30.25 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.575899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4449  YheO domain-containing protein  30.25 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3919  YheO-like  30.25 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  30.53 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  30.53 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3404  YheO domain-containing protein  30.84 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  32.46 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4342  YheO domain-containing protein  29.66 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2000  YheO domain-containing protein  28.23 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35427  normal  0.0222508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1494  hypothetical protein  30.25 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101034  normal  0.19833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2249  YheO domain protein  30.56 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2555  YheO domain protein  26.62 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0613  YheO domain-containing protein  29.63 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1367  YheO domain-containing protein  31.21 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  35.09 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  31.73 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0108  YheO domain protein  28.45 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3512  putative DNA-binding protein  27.5 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.122215 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1451  hypothetical protein  29.79 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.112752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  25.9 
 
 		 580 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1209  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  31.15 
 
 		 224 aa  49.3  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  28.97 
 
 		 230 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000217954  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3043  YheO domain protein  24.64 
 
 		 218 aa  48.9  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1492  YheO domain-containing protein  27.93 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4888  YheO domain-containing protein  29.37 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0312  YheO domain protein  29.85 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  28.36 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0265  YheO domain protein  31.5 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.205654  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  31.09 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4014  YheO domain protein  28.36 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.182407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  31.09 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0394  YheO domain protein  28.36 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00468087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3763  YheO domain-containing protein  26.12 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000101154  hitchhiker  0.00366713 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  30.25 
 
 		 240 aa  46.2  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000230271  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03148  hypothetical protein  26.12 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000388396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03197  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.12 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000385535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0367  YheO domain protein  26.12 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3925  hypothetical protein  26.87 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000338087  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3542  hypothetical protein  26.12 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.9543e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3815  hypothetical protein  26.12 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3627  hypothetical protein  26.12 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000861494  hitchhiker  0.00116448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4555  YheO domain-containing protein  28.36 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495528  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3720  hypothetical protein  26.12 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0367  YheO domain-containing protein  26.12 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0271  YheO domain-containing protein  26.87 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835286  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3682  hypothetical protein  26.87 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00382981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  31.82 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3820  hypothetical protein  26.12 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000148293  normal  0.984767 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3649  hypothetical protein  26.12 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000157298  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3648  hypothetical protein  26.12 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000508468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  31.03 
 
 		 227 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3757  hypothetical protein  26.12 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0543637  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3722  hypothetical protein  26.12 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000194242  normal  0.0632253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4655  hypothetical protein  26.12 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000142414  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  29.37 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  29.06 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  30.17 
 
 		 226 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0689  YheO domain-containing protein  27.91 
 
 		 225 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  30.09 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>