29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4175 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  51.94 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  44.78 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  46.28 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  45.9 
 
 		 211 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  41.95 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  42.79 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  42.36 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  35.78 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  32.54 
 
 		 231 aa  121  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  31.16 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  33.51 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  32.86 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  30.5 
 
 		 234 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  30.5 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  30.5 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  30.5 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  30.5 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  33.03 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  30.14 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  29.35 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  30.05 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  30.88 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  29.21 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  28.71 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6233  sex pilus assembly and synthesis protein  31.53 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  22.66 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4208  hypothetical protein  25.68 
 
 		 431 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000759939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0098  type IV conjugative transfer system protein TraW  27.32 
 
 		 421 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.122831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>