27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0973 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  31.86 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  34.05 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  31.86 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.21 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  28.08 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  26.37 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  26.6 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  24.46 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  25.35 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  26.6 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  24.32 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  25.74 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  25.98 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  25.98 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  25.98 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  25.98 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  22.01 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  25.98 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  22.66 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  21.05 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  26.19 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  24.17 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  22.4 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4208  hypothetical protein  22.11 
 
 		 431 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000759939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  21.77 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  23.67 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>