27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0022 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  440  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  34.36 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  32.21 
 
 
206 aa  118  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  32.43 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  33.68 
 
 
215 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  34.76 
 
 
234 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  34.76 
 
 
234 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  34.76 
 
 
234 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  34.76 
 
 
234 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  34.76 
 
 
234 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  34.41 
 
 
233 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  30.41 
 
 
218 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  32.62 
 
 
231 aa  98.2  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  29.63 
 
 
217 aa  91.3  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  31.5 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  27.89 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  31.91 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  31.35 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  26.9 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  30.05 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  26.6 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  24.19 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  28 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  25.39 
 
 
218 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6233  sex pilus assembly and synthesis protein  24.12 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  24.17 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  25.53 
 
 
200 aa  51.6  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>