28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6168 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  60.21 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  41.95 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  43.65 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  41.76 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  38.81 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  39.27 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  40.54 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  35.96 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  33.67 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  34.97 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6233  sex pilus assembly and synthesis protein  32.87 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  32.07 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  33.84 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.68 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  35.5 
 
 		 234 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.5 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.5 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.5 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.5 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  29.81 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  29.13 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  34.72 
 
 		 218 aa  91.7  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  29.08 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  26.63 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  28.08 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  24.19 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0098  type IV conjugative transfer system protein TraW  25.85 
 
 		 421 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.122831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>