27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4625 on replicon NC_009999
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  97.86 
 
 		 234 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  97.44 
 
 		 233 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  52.43 
 
 		 218 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  37.16 
 
 		 208 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  37.61 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  36.24 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  35.35 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  36.16 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  35.12 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  35 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  33.66 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  35.5 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.5 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  33.33 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  30.37 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  34.78 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  35.42 
 
 		 210 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  30.66 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  32.84 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  29.74 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  28.77 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6233  sex pilus assembly and synthesis protein  25.55 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  25.11 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>