28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_4002 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  463  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  53.81 
 
 		 217 aa  214  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  47.49 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  39.78 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  40.1 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  40.64 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  41.15 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  37.91 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  38.71 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  36.7 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.5 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  34.97 
 
 		 210 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.81 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.81 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.81 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.81 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  37.31 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  32.86 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  35.05 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  35.92 
 
 		 210 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  32.62 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  26.17 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  26.09 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  26.49 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6233  sex pilus assembly and synthesis protein  27.69 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  25.82 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4208  hypothetical protein  23.85 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000759939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>