29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2657 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  418  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  92.89 
 
 		 211 aa  373  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  74.07 
 
 		 212 aa  299  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  44.78 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  42.25 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  39.27 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  41.83 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  40.58 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  41.95 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  39.06 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  37.44 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  36.27 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.96 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.78 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.78 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.78 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.78 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  40.64 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  35.15 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  31.82 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  31.53 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  31.5 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6233  sex pilus assembly and synthesis protein  31.16 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  25.87 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  25.35 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  26.56 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  25.13 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1095  pilus assembly protein TraW, putative  24.75 
 
 		 422 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.521873  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0098  type IV conjugative transfer system protein TraW  24.51 
 
 		 421 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.122831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>