27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4504 on replicon NC_011665
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  97.44 
 
 		 234 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  97.44 
 
 		 234 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  97.44 
 
 		 234 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  97.44 
 
 		 234 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  97.01 
 
 		 234 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  51.71 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  37.79 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  37.33 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  36.87 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  35.51 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  36.32 
 
 		 215 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  34.8 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  35.18 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  35.68 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.68 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  30.99 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  32.04 
 
 		 230 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  34.95 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  35.45 
 
 		 210 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  31.75 
 
 		 212 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  31.84 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  30.93 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  28.7 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  25.66 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6233  sex pilus assembly and synthesis protein  25.22 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>