29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1531 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  70 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  74.05 
 
 		 211 aa  295  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  45.32 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  44.06 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  40.7 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  41.71 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  35.29 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  36.55 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  36.76 
 
 		 231 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  37.31 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  35.64 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  34.83 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.15 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.15 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.15 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.15 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  32.5 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  32.99 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  30.5 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  35.29 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  31.91 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  28.21 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  27.14 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  28.43 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6233  sex pilus assembly and synthesis protein  29.86 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  26.24 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0098  type IV conjugative transfer system protein TraW  24.4 
 
 		 421 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.122831 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1095  pilus assembly protein TraW, putative  22.99 
 
 		 422 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.521873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>