30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4292 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  100 
 
 
206 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  44.29 
 
 
210 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  39.67 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  40.5 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  39.38 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  37.11 
 
 
208 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  33.67 
 
 
210 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  36.73 
 
 
230 aa  134  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  37.44 
 
 
218 aa  133  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  37.44 
 
 
210 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  35.94 
 
 
212 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  35.27 
 
 
212 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.81 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  37.3 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  37.13 
 
 
234 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.13 
 
 
234 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.13 
 
 
234 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.13 
 
 
234 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.13 
 
 
234 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  35.78 
 
 
212 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  32.21 
 
 
211 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  33 
 
 
213 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  28.99 
 
 
218 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  25.98 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  26.63 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  26.6 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6233  sex pilus assembly and synthesis protein  28.78 
 
 
222 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1095  pilus assembly protein TraW, putative  21.67 
 
 
422 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.521873  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0098  type IV conjugative transfer system protein TraW  25.49 
 
 
421 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.122831 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4208  hypothetical protein  27.18 
 
 
431 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000759939  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>