19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0098 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0098  type IV conjugative transfer system protein TraW  100 
 
 		 421 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.122831 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4208  hypothetical protein  26.75 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000759939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1095  pilus assembly protein TraW, putative  25.24 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.521873  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  26.26 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  25.37 
 
 		 230 aa  57  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  26.67 
 
 		 212 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  24.49 
 
 		 218 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  25.56 
 
 		 218 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  26.96 
 
 		 211 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  26.07 
 
 		 210 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  25.49 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  25.85 
 
 		 210 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  27.54 
 
 		 213 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5378  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  33.33 
 
 		 247 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.890308 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  27.32 
 
 		 212 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  24.51 
 
 		 210 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  24.02 
 
 		 208 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.4 
 
 		 212 aa  46.6  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  24.88 
 
 		 217 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>