30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0027 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  44.29 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  41.71 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  39.89 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  36.61 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  35.07 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  32.07 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  37.24 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  36.79 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  40.64 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  32.43 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  39.88 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  33.51 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  35.29 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  33.03 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.83 
 
 		 233 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.79 
 
 		 234 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.79 
 
 		 234 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.79 
 
 		 234 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  35.79 
 
 		 234 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  35.79 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  35.59 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  28.88 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  32.14 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6233  sex pilus assembly and synthesis protein  29.85 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  27.72 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1095  pilus assembly protein TraW, putative  29.14 
 
 		 422 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.521873  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4208  hypothetical protein  24.74 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000759939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0098  type IV conjugative transfer system protein TraW  26.07 
 
 		 421 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.122831 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  21.77 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>