30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0348 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  60.21 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  42.93 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  41.83 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  43.94 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  42.79 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  43.32 
 
 		 211 aa  148  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  41.08 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  36.73 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  36.61 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  36.97 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  37.23 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  37.06 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  31.86 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  32.04 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  33.17 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  33.33 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  33.33 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  33.33 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  33.33 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6233  sex pilus assembly and synthesis protein  36.5 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  33.84 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  30.84 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  29.67 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  26.9 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  26.5 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0098  type IV conjugative transfer system protein TraW  25.37 
 
 		 421 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.122831 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1095  pilus assembly protein TraW, putative  26.46 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.521873  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  21.05 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4208  hypothetical protein  27.22 
 
 		 431 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000759939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>