13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1095 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1095  pilus assembly protein TraW, putative  100 
 
 		 422 aa  865    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.521873  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0098  type IV conjugative transfer system protein TraW  25.24 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.122831 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4208  hypothetical protein  24.75 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000759939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  26.46 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  29.14 
 
 		 210 aa  57  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  21.67 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  25.53 
 
 		 211 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  24.75 
 
 		 210 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  24.24 
 
 		 218 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.99 
 
 		 212 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0248  hypothetical protein  25.93 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  23.08 
 
 		 218 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>