223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4164 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008765  Ajs_4164  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
241 aa  490  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2900  peptidase M48, Ste24p  29.09 
 
 
283 aa  62.4  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  25.11 
 
 
280 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  30.21 
 
 
285 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  32.86 
 
 
286 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  31.94 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  31.94 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  32.86 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  31.94 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  31.94 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  30.99 
 
 
320 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  31.94 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  31.94 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  31.94 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  31.94 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  31.94 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2118  heat shock protein HtpX  28.65 
 
 
295 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  33.59 
 
 
286 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  30.99 
 
 
320 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  30.56 
 
 
317 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  32.09 
 
 
285 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  32.09 
 
 
285 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  32.09 
 
 
285 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  32.09 
 
 
285 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  32.09 
 
 
285 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  31.11 
 
 
285 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  28.49 
 
 
287 aa  55.1  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1383  heat shock protein HtpX  27.93 
 
 
294 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0715  HtpX domain-containing protein  29.35 
 
 
301 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.931885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  31.85 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  31.65 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  28.97 
 
 
342 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1034  heat shock protein HtpX  31.03 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  29.92 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  31.02 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2018  HtpX-2 peptidase  32.48 
 
 
299 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  30.71 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  29.63 
 
 
308 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  32.39 
 
 
307 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  30.86 
 
 
307 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0373  heat shock protein HtpX  27.37 
 
 
290 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  29.63 
 
 
313 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  30.48 
 
 
298 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1860  peptidase M48 Ste24p  32.43 
 
 
299 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  29.29 
 
 
283 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  28.51 
 
 
296 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1987  heat shock protein HtpX  25.09 
 
 
293 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2215  peptidase M48, Ste24p  26.48 
 
 
303 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1983  heat shock protein HtpX  25.09 
 
 
293 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  0.0234339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1287  heat shock protein HtpX  25.09 
 
 
293 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000384328  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0423  peptidase M48 Ste24p  25.11 
 
 
298 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.666925  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0247  heat shock protein HtpX  25.11 
 
 
298 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  29.92 
 
 
285 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2045  heat shock protein HtpX  25.09 
 
 
293 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1471  heat shock protein HtpX  25.09 
 
 
293 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  0.222056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 
287 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2595  heat shock protein HtpX  29.89 
 
 
287 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000042859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1945  peptidase M48 Ste24p  31.76 
 
 
299 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  31.47 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  31.45 
 
 
288 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  28.95 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  30.6 
 
 
316 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  27.87 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  31.48 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0535  HtpX domain protein  26.32 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0793036  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01800  heat shock protein HtpX  25.26 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2561  heat shock protein HtpX  25.26 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000337122  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1920  heat shock protein HtpX  25.26 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000729476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1787  heat shock protein HtpX  29.89 
 
 
287 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000109217  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2662  heat shock protein HtpX  25.44 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000479868  hitchhiker  0.00874622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  31.16 
 
 
310 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1803  heat shock protein HtpX  25.26 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  normal  0.04369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1674  heat shock protein HtpX  25.44 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00952626  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1784  heat shock protein HtpX  25.44 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000381435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  28.32 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2058  heat shock protein HtpX  25.26 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  29.1 
 
 
282 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2097  heat shock protein HtpX  25.26 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2120  heat shock protein HtpX  25.96 
 
 
292 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000401821  hitchhiker  0.0000953283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2672  heat shock protein HtpX  29.89 
 
 
287 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000024307  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  29.28 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01788  hypothetical protein  25.26 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2557  heat shock protein HtpX  29.89 
 
 
287 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000224131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1358  heat shock protein HtpX  25.26 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00135277  normal  0.0441345 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  29.95 
 
 
299 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  30.22 
 
 
293 aa  49.7  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  28.67 
 
 
316 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  28.89 
 
 
315 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1443  heat shock protein HtpX  27.75 
 
 
296 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000816219  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  27.04 
 
 
290 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1813  HtpX domain protein  26.04 
 
 
293 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  25.68 
 
 
325 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2058  HtpX domain protein  27.27 
 
 
294 aa  49.3  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000452797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  30.61 
 
 
309 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2351  heat shock protein HtpX  29.89 
 
 
287 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133306  decreased coverage  0.000000000558904 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2423  heat shock protein HtpX  29.89 
 
 
287 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000296306  decreased coverage  0.000159702 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  28.63 
 
 
287 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  25.68 
 
 
325 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0528  heat shock protein HtpX  27.61 
 
 
294 aa  48.5  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  25.76 
 
 
292 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>