13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4163 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008765  Ajs_4163  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3669  hypothetical protein  46.97 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4020  hypothetical protein  45.45 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858769  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0258  hypothetical protein  42.67 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126722 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5035  hypothetical protein  46.38 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204679  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2915  hypothetical protein  38.96 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169385  normal  0.296094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4127  hypothetical protein  38.96 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176442 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5355  hypothetical protein  43.55 
 
 
93 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3332  hypothetical protein  39.39 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1927  hypothetical protein  37.31 
 
 
75 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.806374  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13630  hypothetical protein  39.71 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.848442  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1221  hypothetical protein  39.71 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5343  PRC-barrel  36.67 
 
 
186 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.981987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>