137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0724 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  97 
 
 		 195 aa  351  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  97 
 
 		 195 aa  351  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  69.06 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  60.89 
 
 		 157 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  64.97 
 
 		 156 aa  194  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  57.45 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  64.41 
 
 		 157 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  60.23 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  60.23 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  60.23 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  60.23 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  60.23 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04010  inner membrane protein  59.66 
 
 		 158 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3852  FxsA cytoplasmic membrane protein  59.66 
 
 		 158 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03972  hypothetical protein  59.66 
 
 		 158 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4381  FxsA  59.66 
 
 		 158 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4695  FxsA  59.66 
 
 		 158 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3872  FxsA  59.66 
 
 		 158 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4669  FxsA  59.66 
 
 		 158 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.5 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0327  FxsA  56.65 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4609  FxsA  74.17 
 
 		 158 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432194  normal  0.600048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.75 
 
 		 195 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.65 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.98 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.27 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.76 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.76 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.76 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  41.88 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  42.94 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  42.33 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  43.12 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.52 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.91 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.18 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  38.31 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  36.2 
 
 		 187 aa  99.4  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.6 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.98 
 
 		 161 aa  98.2  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.82 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  32.03 
 
 		 155 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.16 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.96 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.12 
 
 		 161 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.94 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  31.37 
 
 		 155 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.73 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  33.53 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.95 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.21 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  30.11 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.95 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  40.37 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.87 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  40.37 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  40.22 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.09 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.14 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.06 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.24 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  40.2 
 
 		 157 aa  72  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.39 
 
 		 132 aa  72  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.33 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.89 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  32.3 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.25 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.75 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.94 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1039  fxsA protein  37.41 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  35.29 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  35.29 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  35.29 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  35.29 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  37.82 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  31.68 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  31.68 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.53 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  34.65 
 
 		 129 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.44 
 
 		 131 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  34.31 
 
 		 129 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.34 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.44 
 
 		 131 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  37.37 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  39 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  34.31 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.97 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  34.31 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  27.5 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0670  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.83 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4503  FxsA  32.67 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329001  decreased coverage  0.000252852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  31.03 
 
 		 129 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.07 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0008  hypothetical protein  35.48 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.07 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.08 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  30.25 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>