132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5815 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  100 
 
 
181 aa  348  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  48.82 
 
 
170 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.14 
 
 
154 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
217 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  34.13 
 
 
167 aa  92.8  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.44 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.12 
 
 
161 aa  92  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.38 
 
 
195 aa  91.7  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.96 
 
 
161 aa  91.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  35.54 
 
 
151 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.81 
 
 
215 aa  88.6  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  33.95 
 
 
161 aa  88.6  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  30.94 
 
 
178 aa  85.5  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.07 
 
 
130 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  32.14 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  32.74 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.9 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.17 
 
 
131 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1761  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  39.55 
 
 
224 aa  81.3  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0813114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  41.67 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  42 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  41.67 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  30.58 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.69 
 
 
202 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.83 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  41.07 
 
 
153 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  34.86 
 
 
129 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  29.75 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  30.58 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  30.58 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  30.58 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  30.58 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  31.4 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.8 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  30.58 
 
 
129 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.71 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.39 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.06 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  33.72 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.24 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.19 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.52 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.73 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.14 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1790  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.32 
 
 
130 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.611634  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.43 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.33 
 
 
151 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.46 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14100  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  36.44 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0286882  normal  0.429817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.05 
 
 
131 aa  72  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.89 
 
 
173 aa  72  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  38 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.38 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0805  cytoplasmic membrane protein FsxA  40 
 
 
130 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.399076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.32 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  33.33 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  30.6 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  33.33 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  33.33 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  36 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.33 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  34.38 
 
 
191 aa  67.4  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.11 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.29 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.72 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  26.32 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.53 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  34.18 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0966  FxsA  41.33 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.778639 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  39.05 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  40.21 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.63 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.85 
 
 
194 aa  62.4  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.43 
 
 
132 aa  61.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38890  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  48.72 
 
 
155 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.700662  normal  0.406988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.3 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4503  FxsA  38.18 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329001  decreased coverage  0.000252852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4267  FxsA  35.61 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.69 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  27.59 
 
 
96 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.71 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.71 
 
 
206 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.71 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.41 
 
 
157 aa  58.2  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.2 
 
 
200 aa  58.2  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1282  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.95 
 
 
163 aa  57.8  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.01 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.04 
 
 
186 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
239 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1039  fxsA protein  35.56 
 
 
143 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  33.97 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.97 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.94 
 
 
166 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  39.32 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1891  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.18 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277651  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2390  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.26 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260123  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>