137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0447 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 
194 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.31 
 
 
154 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  35.26 
 
 
167 aa  125  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.92 
 
 
158 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.88 
 
 
159 aa  117  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  46.92 
 
 
217 aa  115  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.69 
 
 
131 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  50 
 
 
158 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.98 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.97 
 
 
161 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  45.08 
 
 
132 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.5 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.5 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  34.12 
 
 
172 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  46.15 
 
 
196 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  44.35 
 
 
161 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.5 
 
 
202 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  32.76 
 
 
178 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.63 
 
 
187 aa  104  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  34.27 
 
 
172 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.5 
 
 
161 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.28 
 
 
195 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.97 
 
 
215 aa  101  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.88 
 
 
175 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.1 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  40.91 
 
 
178 aa  99  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  51.06 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.76 
 
 
192 aa  98.2  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.02 
 
 
130 aa  97.8  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  36.92 
 
 
137 aa  97.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.05 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.52 
 
 
131 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  42 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  33.68 
 
 
187 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.57 
 
 
186 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.52 
 
 
163 aa  95.1  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  42.2 
 
 
157 aa  92.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.99 
 
 
157 aa  92  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.25 
 
 
131 aa  91.7  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  34.81 
 
 
155 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  34.62 
 
 
155 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.8 
 
 
130 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.95 
 
 
163 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.47 
 
 
197 aa  87  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  29.15 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  29.15 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  33.9 
 
 
151 aa  85.5  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  28.43 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.29 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.56 
 
 
170 aa  85.1  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  32.5 
 
 
129 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  31.67 
 
 
129 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  30.83 
 
 
129 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.94 
 
 
170 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.25 
 
 
154 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  36.79 
 
 
129 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  30.59 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  30.59 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  35.85 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  31.67 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  31.67 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  31.67 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  31.67 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
161 aa  82  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.45 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.56 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.81 
 
 
156 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  32.34 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.53 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.35 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.41 
 
 
157 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.94 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.35 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.09 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.35 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  32.34 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0805  cytoplasmic membrane protein FsxA  41.03 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  29.76 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  38.46 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  39.84 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3107  FxsA cytoplasmic membrane protein  50 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00439581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.48 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4379  cytoplasmic membrane family protein  34.23 
 
 
164 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1790  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.83 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.611634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1282  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.59 
 
 
163 aa  72  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  38.18 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  38.18 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  38.18 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  38.18 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  38.18 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4074  FxsA  34.23 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.283215  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.09 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  37.76 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.4 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1039  fxsA protein  42.86 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  30.77 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  32 
 
 
158 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  32 
 
 
158 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  30.68 
 
 
96 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  28.05 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>