132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0955 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  100 
 
 
172 aa  344  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  48.84 
 
 
167 aa  163  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  46.55 
 
 
178 aa  154  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  46.82 
 
 
172 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  47.9 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  46.82 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.86 
 
 
196 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.53 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.13 
 
 
202 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.13 
 
 
202 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.13 
 
 
202 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.2 
 
 
202 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.7 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.86 
 
 
215 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  43.86 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.29 
 
 
217 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.31 
 
 
187 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.46 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.29 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.12 
 
 
158 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.46 
 
 
197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.89 
 
 
163 aa  111  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.29 
 
 
197 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.94 
 
 
159 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.7 
 
 
175 aa  104  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.36 
 
 
165 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.98 
 
 
131 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.09 
 
 
154 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.35 
 
 
173 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.77 
 
 
206 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.77 
 
 
206 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  36.18 
 
 
157 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.14 
 
 
206 aa  101  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.31 
 
 
130 aa  97.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.26 
 
 
158 aa  97.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.75 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  38.26 
 
 
151 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.09 
 
 
129 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.47 
 
 
196 aa  95.5  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.32 
 
 
132 aa  94  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  38.26 
 
 
129 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  38.26 
 
 
129 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  41.9 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.14 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  37.39 
 
 
129 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  39.66 
 
 
129 aa  90.5  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  36.52 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  36.52 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  36.52 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  48.94 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  36.52 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  37.39 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.74 
 
 
187 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  34.1 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  32.39 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  34.1 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.97 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.95 
 
 
186 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.8 
 
 
130 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.04 
 
 
163 aa  85.1  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.11 
 
 
131 aa  84.3  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.8 
 
 
178 aa  84  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.1 
 
 
151 aa  84  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  44.68 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  42.11 
 
 
226 aa  84  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  44.68 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  30.71 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  28.48 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.83 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.4 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.2 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  40.4 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  30.41 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  28.92 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1282  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.91 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.26 
 
 
131 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  28.31 
 
 
153 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.49 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  28.31 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.51 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.35 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  30 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0805  cytoplasmic membrane protein FsxA  38.89 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.399076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  39.78 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.25 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1790  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.81 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.611634  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.21 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  30 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3107  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.62 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00439581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.82 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  31.65 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  31.65 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  31.65 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  31.65 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  31.65 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4267  FxsA  30.23 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41434 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  32.53 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0008  hypothetical protein  37.19 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.21 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>