138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4669 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04010  inner membrane protein  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3852  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4381  FxsA  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4695  FxsA  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3872  FxsA  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03972  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4669  FxsA  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4609  FxsA  99.37 
 
 
158 aa  316  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432194  normal  0.600048 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  91.14 
 
 
158 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  91.14 
 
 
158 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  91.14 
 
 
158 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  91.14 
 
 
158 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  91.14 
 
 
158 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0327  FxsA  85.35 
 
 
157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000333824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  63.75 
 
 
157 aa  199  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  69.62 
 
 
156 aa  198  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  66.67 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  62.57 
 
 
195 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  62.57 
 
 
195 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  60.8 
 
 
200 aa  190  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  65.19 
 
 
178 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  68.35 
 
 
157 aa  184  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.03 
 
 
196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  40 
 
 
195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  41.45 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  40.24 
 
 
172 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  40.24 
 
 
178 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.99 
 
 
187 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  37.5 
 
 
167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.27 
 
 
217 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.45 
 
 
202 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.73 
 
 
159 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.85 
 
 
202 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.85 
 
 
202 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.85 
 
 
202 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.93 
 
 
215 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  40 
 
 
197 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.36 
 
 
191 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.97 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  34.34 
 
 
187 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.05 
 
 
161 aa  90.5  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  32.89 
 
 
172 aa  88.2  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.06 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.56 
 
 
206 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.56 
 
 
206 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.56 
 
 
206 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.93 
 
 
197 aa  85.5  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 
158 aa  84  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.57 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.74 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.9 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.18 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  29.58 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  29.79 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  35.29 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  34.45 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  34.45 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  34.45 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  34.45 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  34.45 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.34 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  34.45 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  34.45 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  44.44 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  42 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.67 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  38 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.92 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.57 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.42 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.3 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  31.93 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.83 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.31 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  39.33 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  33.01 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1039  fxsA protein  37.21 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.13 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.13 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0008  hypothetical protein  38.89 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  44.58 
 
 
226 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0672  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.28 
 
 
210 aa  67.4  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.62 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.14 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  31.85 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  29.41 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  33.33 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  37.62 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  37.62 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.58 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.64 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0700  inner membrane protein FxsA  39.45 
 
 
205 aa  64.3  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175481  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.24 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  32.35 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  37.96 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1790  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.21 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.611634  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.96 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.19 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.43 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>