129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3285 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 131 aa  253  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  91.6 
 
 		 131 aa  237  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  61.54 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  70.54 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0805  cytoplasmic membrane protein FsxA  62.79 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.399076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1790  FxsA cytoplasmic membrane protein  59.06 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.611634  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  50 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  41.54 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.69 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.53 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.14 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.94 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  43.55 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  39.39 
 
 		 167 aa  90.5  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.44 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  34.92 
 
 		 129 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.29 
 
 		 161 aa  90.1  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.35 
 
 		 158 aa  88.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.71 
 
 		 196 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  34.96 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.17 
 
 		 215 aa  87.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.4 
 
 		 202 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.4 
 
 		 202 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  36.15 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  36.15 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  36.15 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  36.15 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.4 
 
 		 202 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.4 
 
 		 202 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.02 
 
 		 161 aa  87  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  39.52 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  40 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.68 
 
 		 217 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.61 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  34.96 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.71 
 
 		 195 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  34.96 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.88 
 
 		 196 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  41.67 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  32.52 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  33.62 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.35 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.58 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.06 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.43 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.35 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.83 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.61 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.28 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.17 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  36.89 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.54 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.39 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.54 
 
 		 186 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  35.77 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.31 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  36.63 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.8 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  35.29 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1039  fxsA protein  40.74 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  41.49 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  41.49 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  34.26 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.27 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  37.62 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  37.62 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.71 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.04 
 
 		 206 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  34.26 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.71 
 
 		 206 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.71 
 
 		 206 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.58 
 
 		 186 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.29 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  36.36 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3107  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.43 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00439581 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1282  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.29 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.75 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14100  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  37.14 
 
 		 211 aa  60.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0286882  normal  0.429817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  41.67 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.23 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  32.54 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.87 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.9 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  36.27 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  36.27 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  36.27 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  36.63 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.11 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  36.63 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  36.63 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  36.52 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  36.52 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  36.52 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  36.52 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  36.52 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  34.19 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.19 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1604  hypothetical protein  41.54 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302975  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.9 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>