140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4013 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  70.77 
 
 		 195 aa  270  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  78.49 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  65.37 
 
 		 202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  65.99 
 
 		 202 aa  251  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  65.99 
 
 		 202 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  65.99 
 
 		 202 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  69.02 
 
 		 215 aa  234  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  62.09 
 
 		 217 aa  220  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  73.66 
 
 		 197 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  61.54 
 
 		 196 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  61.86 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  62.69 
 
 		 197 aa  195  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  64.25 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  64.25 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  64.25 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  51.76 
 
 		 178 aa  161  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  52.35 
 
 		 172 aa  160  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  47.73 
 
 		 167 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  48 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.11 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.86 
 
 		 159 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  40.23 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.24 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.15 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  42.53 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.99 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  41.67 
 
 		 129 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  40.83 
 
 		 129 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  40.83 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  40.83 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  40.83 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  40.83 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  40 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  40 
 
 		 129 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.76 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  50 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.32 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.04 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  46.09 
 
 		 158 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  37.99 
 
 		 200 aa  95.5  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  45.1 
 
 		 129 aa  94.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  35.21 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.12 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  34.75 
 
 		 155 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  36.26 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  36.26 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.67 
 
 		 154 aa  92  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.65 
 
 		 165 aa  92  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.87 
 
 		 131 aa  91.3  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  42.86 
 
 		 137 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.57 
 
 		 156 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.91 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.04 
 
 		 166 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  36.6 
 
 		 157 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  38.79 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.37 
 
 		 161 aa  88.2  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  54.43 
 
 		 157 aa  87.8  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  47.37 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.98 
 
 		 130 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.03 
 
 		 132 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.51 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  32.22 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.15 
 
 		 161 aa  85.5  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  32.47 
 
 		 169 aa  85.1  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.01 
 
 		 170 aa  85.1  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.71 
 
 		 163 aa  84.7  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.51 
 
 		 131 aa  84.7  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  34 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.36 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.41 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.92 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.42 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  31.9 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  39.8 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  39.8 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4379  cytoplasmic membrane family protein  34.46 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.57 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4074  FxsA  33.77 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.283215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  40.45 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  31.9 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0492  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.51 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  31.9 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.11 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.68 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  34.39 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4503  FxsA  33.11 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329001  decreased coverage  0.000252852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  30 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  28.65 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  34.97 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  34.97 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  34.97 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  34.97 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  34.97 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1282  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.74 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3107  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.32 
 
 		 253 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00439581 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14100  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  33.57 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0286882  normal  0.429817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0805  cytoplasmic membrane protein FsxA  39.34 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.399076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1790  FxsA cytoplasmic membrane protein  35 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.611634  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1295  fxsA cytoplasmic membrane protein  26.92 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>