135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3016 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 
131 aa  259  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  60.77 
 
 
132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  53.04 
 
 
161 aa  120  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  52.68 
 
 
131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  50.42 
 
 
130 aa  114  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  54.46 
 
 
158 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  50 
 
 
131 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  46.09 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  47.83 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  51.3 
 
 
217 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  47.75 
 
 
178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  52.46 
 
 
130 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  40.3 
 
 
137 aa  107  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  52.08 
 
 
191 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  45.54 
 
 
161 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1790  FxsA cytoplasmic membrane protein  50.85 
 
 
130 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.611634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.51 
 
 
154 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  45.45 
 
 
161 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  57.76 
 
 
186 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  37.8 
 
 
151 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  43.64 
 
 
178 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  48.18 
 
 
159 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.75 
 
 
187 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.35 
 
 
215 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.35 
 
 
196 aa  97.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  49.04 
 
 
175 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.35 
 
 
195 aa  97.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  37.01 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.48 
 
 
202 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.48 
 
 
202 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.48 
 
 
202 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  37.01 
 
 
129 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.48 
 
 
202 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  46.02 
 
 
194 aa  96.7  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  45.13 
 
 
157 aa  95.9  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.14 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.35 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  37.01 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  36.22 
 
 
129 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0805  cytoplasmic membrane protein FsxA  50 
 
 
130 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.399076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  36.22 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  36.22 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  36.22 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  36.22 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.87 
 
 
187 aa  92.8  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.44 
 
 
170 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.87 
 
 
191 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  45.54 
 
 
161 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  38.14 
 
 
129 aa  90.1  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  42.98 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.54 
 
 
173 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.22 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.12 
 
 
163 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  43.75 
 
 
187 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.9 
 
 
196 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.07 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.24 
 
 
163 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.96 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.72 
 
 
192 aa  84.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  42.72 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1282  FxsA cytoplasmic membrane protein  51.79 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  41.75 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.61 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.57 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  39.45 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.18 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  48.35 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  35.05 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.14 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.18 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.18 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.18 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  38.26 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  39.45 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  39.45 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1039  fxsA protein  47.42 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3107  FxsA cytoplasmic membrane protein  49.12 
 
 
253 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00439581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  45.28 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  46.99 
 
 
226 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4503  FxsA  39.6 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329001  decreased coverage  0.000252852 
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  34.29 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  34.29 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.36 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.66 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  33.64 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.72 
 
 
192 aa  67  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  38.14 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4379  cytoplasmic membrane family protein  41.84 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  40 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4074  FxsA  41.84 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.283215  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2261  FxsA  45.56 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  41.24 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  41.24 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  41.24 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.97 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.86 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.86 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1604  hypothetical protein  48.48 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302975  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1295  fxsA cytoplasmic membrane protein  34.95 
 
 
177 aa  59.7  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1141  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.6 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123046 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>