139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3664 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  69.39 
 
 		 195 aa  250  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  66.5 
 
 		 202 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  66.5 
 
 		 202 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  66.5 
 
 		 202 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  66.01 
 
 		 202 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  63.98 
 
 		 217 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  64.97 
 
 		 191 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  68.54 
 
 		 187 aa  224  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  59.35 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  65.52 
 
 		 197 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  67.98 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  62.57 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  62.57 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  63.89 
 
 		 197 aa  187  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  61.5 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  51.45 
 
 		 172 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  50 
 
 		 178 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  49.7 
 
 		 167 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  47.59 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  41.81 
 
 		 178 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.7 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.3 
 
 		 159 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.03 
 
 		 161 aa  121  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40 
 
 		 158 aa  115  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  40.7 
 
 		 172 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  45.08 
 
 		 129 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  45.08 
 
 		 129 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  44.26 
 
 		 129 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  44.26 
 
 		 129 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  44.26 
 
 		 129 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  44.26 
 
 		 129 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  43.44 
 
 		 129 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.67 
 
 		 175 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  43.44 
 
 		 129 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  45.1 
 
 		 129 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  38.36 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  38.36 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  48.96 
 
 		 191 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.31 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  40.24 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.35 
 
 		 131 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.61 
 
 		 158 aa  95.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.88 
 
 		 132 aa  95.1  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  40 
 
 		 156 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.52 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  46.15 
 
 		 130 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  37.7 
 
 		 151 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.74 
 
 		 154 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.75 
 
 		 165 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.98 
 
 		 157 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  51.58 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.13 
 
 		 131 aa  91.3  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.24 
 
 		 186 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  33.77 
 
 		 155 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  43.59 
 
 		 157 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  55 
 
 		 157 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  31.82 
 
 		 155 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  43.81 
 
 		 137 aa  89.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 163 aa  88.6  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.88 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.71 
 
 		 131 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.15 
 
 		 170 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.31 
 
 		 161 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.4 
 
 		 163 aa  85.5  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  34.36 
 
 		 153 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.44 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  37.86 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.19 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  42.39 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  34.36 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  31.05 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.04 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  33.54 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.29 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  32.4 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.51 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.17 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  45.74 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  45.74 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  45.74 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  45.74 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  45.74 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  38.38 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4503  FxsA  34.46 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329001  decreased coverage  0.000252852 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  38.38 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.55 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3107  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.5 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00439581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.68 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1790  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.17 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.611634  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0327  FxsA  44.68 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 155 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.48 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1282  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.67 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  34.21 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4074  FxsA  34.67 
 
 		 164 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.283215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0805  cytoplasmic membrane protein FsxA  43.33 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.399076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3872  FxsA  33.33 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4669  FxsA  33.33 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>