135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0805 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0805  cytoplasmic membrane protein FsxA  100 
 
 		 130 aa  239  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.399076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  79.07 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  73.85 
 
 		 130 aa  167  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  62.79 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  62.79 
 
 		 131 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1790  FxsA cytoplasmic membrane protein  64.84 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.611634  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  50 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  41.54 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.32 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  45.05 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.62 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  45.45 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  50.5 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  49.17 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  41.46 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.86 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  55.21 
 
 		 186 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  35.77 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  47.06 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  35.77 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  41.32 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  36.21 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  36.21 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  36.21 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  36.21 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.74 
 
 		 217 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  44.44 
 
 		 178 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  44.44 
 
 		 172 aa  90.5  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.59 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.74 
 
 		 195 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  45.54 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.36 
 
 		 151 aa  87  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.33 
 
 		 215 aa  87.4  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.81 
 
 		 196 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  34.96 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  34.96 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.05 
 
 		 194 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  40 
 
 		 191 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.44 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  41.49 
 
 		 191 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.02 
 
 		 202 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.02 
 
 		 202 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.02 
 
 		 202 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  35.34 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.02 
 
 		 202 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.84 
 
 		 187 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  38.89 
 
 		 181 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.5 
 
 		 187 aa  83.6  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.31 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.62 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.41 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.43 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  42.71 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.1 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.37 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  36.63 
 
 		 178 aa  80.1  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1282  FxsA cytoplasmic membrane protein  46.43 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  43 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  35.48 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  38.89 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.12 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.35 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  45.56 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.32 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.82 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.82 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.82 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.82 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1039  fxsA protein  47.78 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.18 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.17 
 
 		 200 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  34.48 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  34.48 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  33.06 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.96 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  41.76 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  41.76 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1604  hypothetical protein  49.23 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302975  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3107  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.92 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00439581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.15 
 
 		 186 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.46 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1295  fxsA cytoplasmic membrane protein  35.24 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.56 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  36.45 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  38.82 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2261  FxsA  46.24 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  39.24 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  39.24 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  39.24 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  39.13 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  39.13 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  39.13 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  39.13 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  39.13 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.46 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.5 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.92 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1580  FxsA  43.66 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.413909  normal  0.915122 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14100  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  36.36 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0286882  normal  0.429817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  47.31 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>