141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3264 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 
197 aa  394  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  73.58 
 
 
195 aa  268  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  64.88 
 
 
202 aa  247  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  64.88 
 
 
202 aa  247  9e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  64.88 
 
 
202 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  64.88 
 
 
202 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  72.87 
 
 
191 aa  242  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  62.38 
 
 
196 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  73.21 
 
 
215 aa  234  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  71.51 
 
 
187 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  65.32 
 
 
217 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  62.56 
 
 
187 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  63.21 
 
 
197 aa  197  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  62.11 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  62.11 
 
 
206 aa  194  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  61.05 
 
 
206 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  54.07 
 
 
172 aa  171  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  52.91 
 
 
178 aa  170  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  48 
 
 
167 aa  157  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  47.02 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.9 
 
 
161 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.69 
 
 
159 aa  131  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.52 
 
 
161 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  37.5 
 
 
178 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  44.94 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.36 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.35 
 
 
158 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  42.86 
 
 
129 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  40 
 
 
178 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  42.86 
 
 
129 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  42.02 
 
 
129 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  42.02 
 
 
129 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  42.02 
 
 
129 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  42.02 
 
 
129 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  34.87 
 
 
195 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  34.87 
 
 
195 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  41.18 
 
 
129 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  41.18 
 
 
129 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  37.77 
 
 
200 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.6 
 
 
166 aa  101  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  32.92 
 
 
155 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.32 
 
 
157 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.45 
 
 
156 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.46 
 
 
158 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.87 
 
 
165 aa  98.2  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.79 
 
 
154 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.6 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  37.82 
 
 
129 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.62 
 
 
132 aa  95.9  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.22 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  32.08 
 
 
155 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  47.92 
 
 
191 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  57.5 
 
 
157 aa  94.7  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.61 
 
 
131 aa  94.7  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.44 
 
 
130 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  42.86 
 
 
137 aa  91.7  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.1 
 
 
131 aa  91.3  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  43.48 
 
 
157 aa  91.3  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.46 
 
 
173 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  36.13 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.42 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.53 
 
 
163 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  34.81 
 
 
168 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  47.71 
 
 
226 aa  89.4  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.95 
 
 
163 aa  89.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  33.54 
 
 
153 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.51 
 
 
131 aa  88.2  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.62 
 
 
186 aa  87.8  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  31.82 
 
 
169 aa  88.2  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  33.54 
 
 
153 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  33.54 
 
 
153 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  38.64 
 
 
158 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  38.64 
 
 
158 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  38.64 
 
 
158 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  38.64 
 
 
158 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  38.64 
 
 
158 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  40 
 
 
170 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.43 
 
 
196 aa  85.5  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
161 aa  85.1  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.54 
 
 
130 aa  84.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04010  inner membrane protein  41.57 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3852  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.57 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  32.16 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  32.16 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03972  hypothetical protein  41.57 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4381  FxsA  41.57 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4695  FxsA  41.57 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3872  FxsA  41.57 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4669  FxsA  41.57 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  41.57 
 
 
96 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.14 
 
 
161 aa  82  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.29 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.13 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.59 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.82 
 
 
129 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1580  FxsA  40.13 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.413909  normal  0.915122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4379  cytoplasmic membrane family protein  34 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  35.06 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0327  FxsA  38.29 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000333824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3107  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.5 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00439581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>