100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0792 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.73 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.92 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.96 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.04 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.94 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.95 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.18 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.91 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.91 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.91 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.91 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.27 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.66 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  39.58 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.5 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.31 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.36 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.49 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.65 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.34 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.03 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.24 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  30.83 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.22 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  31.09 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  30.83 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  35.58 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.27 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  30.25 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  34 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  29.41 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  29.41 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  29.41 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  29.41 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  30.77 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.69 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.61 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  27 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  26.5 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.29 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  34.04 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  32.65 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  27.33 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.11 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  28.57 
 
 		 129 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  29.37 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.57 
 
 		 157 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  32 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.73 
 
 		 154 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.54 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.71 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.73 
 
 		 161 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.06 
 
 		 156 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.57 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.83 
 
 		 130 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0805  cytoplasmic membrane protein FsxA  39.17 
 
 		 130 aa  52  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.399076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  34.65 
 
 		 168 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  34.83 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.11 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  34.83 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  34.83 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.98 
 
 		 129 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.96 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.1 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.1 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.1 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3107  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.68 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00439581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  37.37 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  37.37 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0670  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.93 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  36 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.86 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  26.36 
 
 		 151 aa  48.9  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.07 
 
 		 163 aa  48.5  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.57 
 
 		 151 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  28.57 
 
 		 96 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.18 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1790  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.76 
 
 		 130 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.611634  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  24.84 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2675  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.55 
 
 		 159 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546891  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.35 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.3 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.48 
 
 		 170 aa  45.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.07 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1891  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.33 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  32.38 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.07 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  37.07 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  32.38 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  45.1 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15960  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  36.54 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248506  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.89 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.38 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  41.58 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1761  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  31.86 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0813114  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2261  FxsA  35.16 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1295  fxsA cytoplasmic membrane protein  25 
 
 		 177 aa  41.2  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>