140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2035 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 
159 aa  313  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  50 
 
 
196 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.85 
 
 
217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.86 
 
 
191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.62 
 
 
195 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  48.34 
 
 
202 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  48.34 
 
 
202 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  48.34 
 
 
202 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.88 
 
 
161 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.62 
 
 
202 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.66 
 
 
187 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  43.79 
 
 
161 aa  121  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.3 
 
 
215 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.88 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.14 
 
 
175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  37.13 
 
 
178 aa  117  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  37.93 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  36.88 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  40 
 
 
187 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  36.53 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.27 
 
 
197 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  57.14 
 
 
206 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  57.14 
 
 
206 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  57.14 
 
 
206 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.67 
 
 
194 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  57.14 
 
 
197 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  48.18 
 
 
131 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.67 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.86 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.76 
 
 
161 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.86 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  46.46 
 
 
196 aa  95.5  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  46.85 
 
 
132 aa  94.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  37.01 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.88 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  42.45 
 
 
129 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.62 
 
 
157 aa  90.9  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  38.03 
 
 
155 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  32.9 
 
 
168 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  44.12 
 
 
137 aa  90.5  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  38.03 
 
 
155 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  41.35 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.44 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  37.91 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.13 
 
 
178 aa  89  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  39.38 
 
 
158 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  39.38 
 
 
158 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  39.38 
 
 
158 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  39.38 
 
 
158 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  39.38 
 
 
158 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  41.51 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  41.51 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  41.51 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  41.51 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.53 
 
 
165 aa  87.8  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  40.57 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  37.91 
 
 
153 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  33.11 
 
 
172 aa  87  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.96 
 
 
187 aa  87  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  47.87 
 
 
191 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  37.1 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  39.62 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  37.25 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  39.86 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.58 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.96 
 
 
166 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  34.18 
 
 
195 aa  84  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  34.18 
 
 
195 aa  84  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.77 
 
 
163 aa  84  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.41 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.77 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  31.9 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  38.32 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  33.13 
 
 
200 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.73 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.5 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.5 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.32 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  31.68 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  31.68 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.82 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.58 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.09 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.79 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.39 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.79 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04010  inner membrane protein  36.54 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3852  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.54 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03972  hypothetical protein  36.54 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4381  FxsA  36.54 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4695  FxsA  36.54 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3872  FxsA  36.54 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4669  FxsA  36.54 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  42 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  48.19 
 
 
226 aa  71.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  45.05 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4267  FxsA  32.7 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  33.09 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.09 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0805  cytoplasmic membrane protein FsxA  41 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.399076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>