More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Wp23SB on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_R0057  23S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 2640 bp  670    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0057  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2605 bp  735    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0013  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2605 bp  735    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0047  23S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 2640 bp  670    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0069  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2605 bp  735    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0024  23S ribosomal RNA  83.99 
 
 		 2740 bp  745    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335638 
 
 
-
 
NC_002978  Wp23SB  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2746 bp  5444    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r02  23S ribosomal RNA  83.49 
 
 		 2908 bp  678    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r05  23S ribosomal RNA  83.49 
 
 		 2908 bp  678    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.346302  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAr02  23S ribosomal RNA  83.49 
 
 		 2809 bp  678    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.722824  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0039  23S ribosomal RNA  88.74 
 
 		 2799 bp  2343    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0976  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2772 bp  1019    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0222  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2772 bp  2282    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.824571  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0048  23S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 3384 bp  654    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770601 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1790  23S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 2931 bp  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0829238  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1582  23S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 2931 bp  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1018  23S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 2931 bp  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0041  23S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 2875 bp  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0051  23S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 2875 bp  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0038  23S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 2640 bp  670    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0021  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2605 bp  735    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0261  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2820 bp  981    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1083  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2820 bp  981    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.494767  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6009  23SrRNA  84.07 
 
 		 2916 bp  636  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.597843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6016  23SrRNA  84.07 
 
 		 2917 bp  636  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0083  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2844 bp  638  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0056  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2844 bp  638  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0066  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2844 bp  638  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0074  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2844 bp  638  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164783  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0005  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2844 bp  638  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0045  23S ribosomal RNA  82.52 
 
 		 2736 bp  626  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.351747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0033  23S ribosomal RNA  82.52 
 
 		 2736 bp  626  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0021  23S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 2830 bp  605  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0009  23S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 2830 bp  605  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0005  23S ribosomal RNA  83.3 
 
 		 2843 bp  567  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0040  23S ribosomal RNA  83.3 
 
 		 2843 bp  567  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.702557  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_r2  23S ribosomal RNA  83.3 
 
 		 2818 bp  567  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00999234  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0066  23S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 2921 bp  533  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0039  23S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 2921 bp  533  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.409149 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0051  23S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 2921 bp  533  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0058  23S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 2921 bp  533  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4295  23S ribosomal RNA  82.22 
 
 		 2883 bp  515  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4350  23S ribosomal RNA  82.22 
 
 		 2883 bp  515  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4502  23S ribosomal RNA  83.31 
 
 		 2232 bp  513  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4505  23S ribosomal RNA  83.31 
 
 		 2232 bp  513  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6502  23S ribosomal RNA  83.31 
 
 		 2236 bp  513  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6505  23S ribosomal RNA  83.31 
 
 		 2232 bp  513  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0005  23S ribosomal RNA  82.22 
 
 		 2918 bp  515  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0053  23S ribosomal RNA  82.22 
 
 		 2918 bp  515  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0060  23S ribosomal RNA  82.22 
 
 		 2918 bp  515  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0066  23S ribosomal RNA  82.22 
 
 		 2918 bp  515  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0004  23S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 2774 bp  511  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0037  23S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 2774 bp  511  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0041  23S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 2774 bp  511  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4355  23S ribosomal RNA  82.11 
 
 		 2882 bp  500  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0079  23S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 2905 bp  468  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175282  normal  0.43862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0071  23S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 2905 bp  468  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0037  23S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 2903 bp  468  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.235964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0011  23S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 2903 bp  468  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0138586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0045  23S ribosomal RNA  80.96 
 
 		 2984 bp  450  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0018  23S ribosomal RNA  80.96 
 
 		 2984 bp  450  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.390452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0040  23S ribosomal RNA  81.12 
 
 		 2883 bp  438  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0016  23S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 2829 bp  434  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.144056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0016  23S ribosomal RNA  81.16 
 
 		 2811 bp  436  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629398  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0048  23S ribosomal RNA  81.16 
 
 		 2811 bp  436  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0070  23S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 2954 bp  430  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0021  23S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 2954 bp  430  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0055  23S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 2954 bp  430  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0060  23S ribosomal RNA  80.46 
 
 		 2954 bp  430  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0005  23S ribosomal RNA  81.03 
 
 		 2884 bp  428  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0054  23S ribosomal RNA  81.03 
 
 		 2884 bp  428  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.879203  normal  0.943233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0021  23S ribosomal RNA  80.36 
 
 		 2850 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.335485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0021  23S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 2847 bp  422  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.727365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0062  23S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 2847 bp  422  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.451716  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0031  23S ribosomal RNA  80.36 
 
 		 2850 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0036  23S ribosomal RNA  80.36 
 
 		 2850 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0007  23S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 2758 bp  418  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0021  23S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 2758 bp  418  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0043  23S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 2758 bp  418  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0061  23S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 2758 bp  418  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  80.4 
 
 		 2983 bp  416  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55130  23S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 2892 bp  416  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0071  23S ribosomal RNA  80.26 
 
 		 2850 bp  414  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.764689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55160  23S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 2892 bp  416  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55010  23S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 2892 bp  416  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55040  23S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 2892 bp  416  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55100  23S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 2892 bp  416  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.694536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55070  23S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 2892 bp  416  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0052  23S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 2830 bp  410  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.121613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0050  23S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 2880 bp  410  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.6901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0055  23S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 2880 bp  410  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0009  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 2832 bp  410  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0067  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 2832 bp  410  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0016  23S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 2863 bp  410  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  80.3 
 
 		 2983 bp  408  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0156  23S ribosomal RNA  81.28 
 
 		 2902 bp  408  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0507  23S ribosomal RNA  81.28 
 
 		 2902 bp  408  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.157689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4191  23S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 2907 bp  406  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18825  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0471  23S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 2907 bp  406  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4291  23S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 2907 bp  406  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.329692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>