More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0222 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  Wp23SB  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2746 bp  2282    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r02  23S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 2908 bp  761    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r05  23S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 2908 bp  761    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.346302  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAr02  23S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 2809 bp  761    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.722824  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0039  23S ribosomal RNA  97.98 
 
 		 2799 bp  5037    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0222  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2772 bp  5495    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.824571  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1582  23S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 2931 bp  753    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1790  23S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 2931 bp  753    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0829238  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1018  23S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 2931 bp  753    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0069  23S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 2605 bp  720    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0013  23S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 2605 bp  720    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0021  23S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 2605 bp  720    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0057  23S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 2605 bp  720    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0261  23S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 2820 bp  698    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1083  23S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 2820 bp  698    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.494767  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0976  23S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 2772 bp  628  1e-177  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0024  23S ribosomal RNA  86.98 
 
 		 2740 bp  488  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0007  23S ribosomal RNA  86.58 
 
 		 2758 bp  470  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0021  23S ribosomal RNA  86.58 
 
 		 2758 bp  470  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0043  23S ribosomal RNA  86.58 
 
 		 2758 bp  470  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0061  23S ribosomal RNA  86.58 
 
 		 2758 bp  470  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0020  23S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 2747 bp  452  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.730998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0040  23S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 2747 bp  452  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0021  23S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 2847 bp  450  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.727365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0062  23S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 2847 bp  450  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.451716  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0045  23S ribosomal RNA  85.9 
 
 		 2784 bp  448  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724852  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0053  23S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 2826 bp  436  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0052  23S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 2830 bp  436  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.121613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA23S1  23S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 2859 bp  436  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA23S2  23S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 2859 bp  436  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143049  normal  0.544061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0009  23S ribosomal RNA  87.61 
 
 		 2832 bp  428  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0067  23S ribosomal RNA  87.61 
 
 		 2832 bp  428  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0009  23S ribosomal RNA  81.83 
 
 		 2910 bp  424  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0241936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0083  23S ribosomal RNA  81.83 
 
 		 2909 bp  424  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0018  23S ribosomal RNA  81.83 
 
 		 2909 bp  424  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0796813  normal  0.0109846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0097  23S ribosomal RNA  81.64 
 
 		 2907 bp  424  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0107  23S ribosomal RNA  81.83 
 
 		 2910 bp  424  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.899366  unclonable  0.000000103212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0102  23S ribosomal RNA  81.83 
 
 		 2910 bp  424  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0618056  normal  0.0486467 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4217  23S ribosomal RNA  81.64 
 
 		 2907 bp  424  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0046  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2902 bp  420  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0057  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2902 bp  420  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2872  23S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 2987 bp  420  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468125  normal  0.745583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4270  23S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 2907 bp  420  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4464  23S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184012  hitchhiker  0.00493648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0275  23S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 2907 bp  420  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.483578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4174  23S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 2905 bp  420  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0037  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 2902 bp  420  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0046  23S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 2827 bp  422  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0018  23S ribosomal RNA  81.44 
 
 		 2984 bp  418  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.390452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0045  23S ribosomal RNA  81.44 
 
 		 2984 bp  418  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0092  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.539989  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0130  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162326  normal  0.132497 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3399  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0629  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000293702  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0471  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0098  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1922  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.264336  normal  0.836086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3469  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4245  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.038197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0096  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0037  23S ribosomal RNA  81.71 
 
 		 2910 bp  416  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.22175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0096  23S ribosomal RNA  81.71 
 
 		 2909 bp  416  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0347251  hitchhiker  0.00115392 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0095  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0093  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644352  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0094  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4191  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18825  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4291  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.329692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4206  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000822099  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4195  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00174928  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4283  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  416  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00262409  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4283  23S ribosomal RNA  81.74 
 
 		 2908 bp  412  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2986  23S ribosomal RNA  81.74 
 
 		 2908 bp  412  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.96543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0050  23S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 2783 bp  410  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0056  23S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 2783 bp  410  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0062  23S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 2783 bp  410  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0008  23S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 2669 bp  412  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4542  23S ribosomal RNA  81.74 
 
 		 2908 bp  412  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.332197  hitchhiker  0.000000000159513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0060  23S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 2669 bp  412  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531271  normal  0.371135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0050  23S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 2818 bp  412  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.502675  normal  0.618699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4587  23S ribosomal RNA  81.74 
 
 		 2908 bp  412  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0737438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0045  23S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 2736 bp  412  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.351747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0033  23S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 2736 bp  412  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0041  23S ribosomal RNA  86.76 
 
 		 2875 bp  408  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0051  23S ribosomal RNA  86.76 
 
 		 2875 bp  408  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0075  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2902 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.704928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0088  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2902 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5054  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2926 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.92584  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4790  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2904 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.273939  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4794  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2904 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00230824  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5075  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2924 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000406527  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0016  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2829 bp  404  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.144056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4121  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2903 bp  404  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257458  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4503  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2903 bp  404  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.167309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4326  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2903 bp  404  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.169785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0103  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2980 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.124857 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0088  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2980 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00984413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0111  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2980 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.547068  hitchhiker  0.0060752 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4762  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2904 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5094  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2924 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000138378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5106  23S ribosomal RNA  81.63 
 
 		 2924 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>