299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0040 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  Gs23SA  23S ribosomal RNA  86.01 
 
 		 2958 bp  866    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  86.01 
 
 		 2958 bp  866    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SA  23S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 2902 bp  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145616  hitchhiker  0.000134511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SB  23S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 2902 bp  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  hitchhiker  0.000114916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SC  23S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 2902 bp  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0640928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SD  23S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 2902 bp  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SE  23S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 2902 bp  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564865  normal  0.184682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SF  23S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 2902 bp  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SG  23S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 2902 bp  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SA  23S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 2904 bp  686    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SB  23S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 2904 bp  686    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00482  23S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 2818 bp  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05581  23S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 2879 bp  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0577053  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_003295  RS05738  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2818 bp  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00792768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05423  ribosomal RNA-23S  83.74 
 
 		 2880 bp  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191828 
 
 
-
 
NC_004310  BR_r02  23S ribosomal RNA  86.7 
 
 		 2908 bp  2311    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r05  23S ribosomal RNA  86.7 
 
 		 2908 bp  2311    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.346302  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAr02  23S ribosomal RNA  86.77 
 
 		 2809 bp  2234    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.722824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0019  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2820 bp  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0050  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2820 bp  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0060  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2820 bp  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996715  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0073  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2820 bp  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0081  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2820 bp  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0084  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2820 bp  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0039  23S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 2799 bp  737    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0016  23S ribosomal RNA  86.35 
 
 		 2829 bp  1386    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.144056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0013  23S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 2913 bp  686    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0027  23S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 2913 bp  686    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R15  23S ribosomal RNA  83.77 
 
 		 2892 bp  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R4  23S ribosomal RNA  83.77 
 
 		 2892 bp  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R44  23S ribosomal RNA  83.77 
 
 		 2892 bp  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R57  23S ribosomal RNA  83.77 
 
 		 2892 bp  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R78  23S ribosomal RNA  83.77 
 
 		 2892 bp  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0420771  normal  0.0126919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R91  23S ribosomal RNA  83.77 
 
 		 2892 bp  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000653016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4295  23S ribosomal RNA  86.82 
 
 		 2883 bp  1392    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4350  23S ribosomal RNA  86.82 
 
 		 2883 bp  1392    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4355  23S ribosomal RNA  86.76 
 
 		 2882 bp  1376    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0049  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2956 bp  763    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0054  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2956 bp  763    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175608  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0018  23S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 2882 bp  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000431257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0072  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2882 bp  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560975  normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0004  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2882 bp  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 2983 bp  835    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  85.51 
 
 		 2983 bp  827    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0007  23S ribosomal RNA  89.33 
 
 		 2758 bp  1386    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0021  23S ribosomal RNA  89.33 
 
 		 2758 bp  1386    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0043  23S ribosomal RNA  89.33 
 
 		 2758 bp  1386    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0061  23S ribosomal RNA  89.33 
 
 		 2758 bp  1386    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2044  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2881 bp  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0408175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1099  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2881 bp  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000727484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2895  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2881 bp  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0262305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3092  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2882 bp  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000732021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0014  23S ribosomal RNA  84.92 
 
 		 2985 bp  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0035  23S ribosomal RNA  84.92 
 
 		 2985 bp  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0052  23S ribosomal RNA  85.72 
 
 		 2830 bp  2020    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.121613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0050  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2783 bp  1935    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0056  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2783 bp  1935    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0062  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2783 bp  1935    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0048  23S ribosomal RNA  87.06 
 
 		 3384 bp  1358    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0021  23S ribosomal RNA  85.44 
 
 		 2847 bp  2024    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.727365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0062  23S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 2847 bp  2032    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.451716  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0009  23S ribosomal RNA  85.74 
 
 		 2832 bp  2123    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0067  23S ribosomal RNA  85.74 
 
 		 2832 bp  2123    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0016  23S ribosomal RNA  85.1 
 
 		 2863 bp  1966    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0051  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2818 bp  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0061  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2818 bp  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0073  23S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 2818 bp  648    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0078  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2818 bp  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0083  23S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 2844 bp  1443    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0056  23S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 2844 bp  1443    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0066  23S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 2844 bp  1443    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0074  23S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 2844 bp  1443    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164783  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0005  23S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 2844 bp  1443    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0045  23S ribosomal RNA  85.15 
 
 		 2784 bp  1834    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724852  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0074  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2881 bp  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407345  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0086  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2881 bp  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0041  23S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 2875 bp  2512    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0051  23S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 2875 bp  2512    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0007  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2898 bp  765    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0012  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2898 bp  765    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31433 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0020  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2747 bp  5446    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.730998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0040  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2747 bp  5446    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0002  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2882 bp  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0458298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0010  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2882 bp  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131744  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0020  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2882 bp  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00244053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0064  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2882 bp  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0081  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2882 bp  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232071  normal  0.0354875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08600  23S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 2891 bp  676    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62060  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2891 bp  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0546487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70880  23S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 2891 bp  676    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.560692 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0062  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2882 bp  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.604931  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0085  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2881 bp  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.271207  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0016  23S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 2811 bp  745    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629398  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0048  23S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 2811 bp  745    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0004  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2774 bp  801    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0037  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2774 bp  801    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0041  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2774 bp  801    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0024  23S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 2556 bp  819    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0314547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0035  23S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 2556 bp  819    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.381491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0051  23S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 2556 bp  819    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0486976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>