More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0976 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  Wp23SB  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2746 bp  1019    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r02  23S ribosomal RNA  81.14 
 
 		 2908 bp  1122    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r05  23S ribosomal RNA  81.14 
 
 		 2908 bp  1122    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.346302  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAr02  23S ribosomal RNA  81.12 
 
 		 2809 bp  1080    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.722824  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1018  23S ribosomal RNA  81.14 
 
 		 2931 bp  1122    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4502  23S ribosomal RNA  86.63 
 
 		 2232 bp  682    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6505  23S ribosomal RNA  86.63 
 
 		 2232 bp  682    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0039  23S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 2799 bp  644    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1582  23S ribosomal RNA  81.14 
 
 		 2931 bp  1122    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0976  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2772 bp  5495    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0048  23S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 3384 bp  763    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770601 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1790  23S ribosomal RNA  81.14 
 
 		 2931 bp  1122    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0829238  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6502  23S ribosomal RNA  86.63 
 
 		 2236 bp  682    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4505  23S ribosomal RNA  86.63 
 
 		 2232 bp  682    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0024  23S ribosomal RNA  87.46 
 
 		 2740 bp  638  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335638 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0222  23S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 2772 bp  628  1e-177  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.824571  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0046  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2902 bp  587  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0057  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2902 bp  587  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0037  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2902 bp  587  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0021  23S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 2847 bp  581  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.727365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0062  23S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 2847 bp  581  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.451716  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0048  23S ribosomal RNA  86.24 
 
 		 2634 bp  575  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0059  23S ribosomal RNA  86.24 
 
 		 2653 bp  575  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0816838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0039  23S ribosomal RNA  86.24 
 
 		 2634 bp  575  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0052  23S ribosomal RNA  86.2 
 
 		 2830 bp  573  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.121613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0009  23S ribosomal RNA  86.2 
 
 		 2832 bp  573  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0067  23S ribosomal RNA  86.2 
 
 		 2832 bp  573  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0057  23S ribosomal RNA  86.05 
 
 		 2640 bp  565  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0016  23S ribosomal RNA  86.05 
 
 		 2829 bp  565  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.144056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0038  23S ribosomal RNA  86.05 
 
 		 2640 bp  565  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0047  23S ribosomal RNA  86.05 
 
 		 2640 bp  565  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0007  23S ribosomal RNA  86.76 
 
 		 2758 bp  563  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0021  23S ribosomal RNA  86.76 
 
 		 2758 bp  563  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0043  23S ribosomal RNA  86.76 
 
 		 2758 bp  563  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0061  23S ribosomal RNA  86.76 
 
 		 2758 bp  563  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0050  23S ribosomal RNA  86.69 
 
 		 2818 bp  557  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.502675  normal  0.618699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0008  23S ribosomal RNA  86.69 
 
 		 2669 bp  557  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0060  23S ribosomal RNA  86.69 
 
 		 2669 bp  557  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531271  normal  0.371135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0053  23S ribosomal RNA  86.69 
 
 		 2826 bp  557  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0057  23S ribosomal RNA  85.65 
 
 		 2605 bp  545  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0021  23S ribosomal RNA  85.65 
 
 		 2605 bp  545  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0069  23S ribosomal RNA  85.65 
 
 		 2605 bp  545  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0046  23S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 2827 bp  543  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0013  23S ribosomal RNA  85.65 
 
 		 2605 bp  545  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0040  23S ribosomal RNA  85.52 
 
 		 2871 bp  541  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0030  23S ribosomal RNA  85.52 
 
 		 2871 bp  541  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA23S1  23S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 2859 bp  541  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA23S2  23S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 2859 bp  541  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143049  normal  0.544061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0016  23S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 2863 bp  533  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0041  23S ribosomal RNA  85.32 
 
 		 2875 bp  527  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0051  23S ribosomal RNA  85.32 
 
 		 2875 bp  527  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0033  23S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 2736 bp  507  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0045  23S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 2736 bp  507  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.351747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0009  23S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 2830 bp  498  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0021  23S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 2830 bp  498  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0039  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 		 2825 bp  478  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00438131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0012  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 		 2815 bp  478  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0031  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 		 2825 bp  478  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.165517  normal  0.805884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0010  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 		 2825 bp  478  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.654352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0010  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2872 bp  480  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.359292  normal  0.478358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0039  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2868 bp  480  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0440125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0018  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 		 2825 bp  478  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0025  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 		 2825 bp  478  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0020  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 		 2815 bp  478  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.789255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0026  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 		 2815 bp  478  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.646004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0041  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 		 2815 bp  478  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0020  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2747 bp  474  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.730998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0040  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2747 bp  474  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0018  23S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 2813 bp  472  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.597901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0033  23S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 2868 bp  472  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0019  23S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 2868 bp  472  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0026  23S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 2868 bp  472  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0031  23S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 2813 bp  472  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0035  23S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 2814 bp  472  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0109668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0048  23S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 2813 bp  472  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0062  23S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 2813 bp  472  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0073  23S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 2813 bp  472  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.864487  normal  0.796617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0033  23S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 2815 bp  470  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0261  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2820 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1083  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 2820 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.494767  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0026  23S ribosomal RNA  83.99 
 
 		 2640 bp  454  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395228  hitchhiker  0.00289875 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0077  23S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 2640 bp  456  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0016  23S ribosomal RNA  83.99 
 
 		 2640 bp  454  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406771  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0054  23S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 2640 bp  456  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.345007  normal  0.439906 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0074  23S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 2640 bp  456  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0479201  decreased coverage  0.0000252846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0041  23S ribosomal RNA  83.99 
 
 		 2640 bp  454  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0004  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 2817 bp  450  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0023  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 2816 bp  450  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0053  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 2814 bp  450  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.652954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0076  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 2798 bp  450  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0028  23S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 2620 bp  450  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.781404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0043  23S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 2620 bp  450  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.980916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0083  23S ribosomal RNA  88.08 
 
 		 2844 bp  444  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0056  23S ribosomal RNA  88.08 
 
 		 2844 bp  444  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0066  23S ribosomal RNA  88.08 
 
 		 2844 bp  444  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0074  23S ribosomal RNA  88.08 
 
 		 2844 bp  444  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164783  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0005  23S ribosomal RNA  88.08 
 
 		 2844 bp  444  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0014  23S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 2598 bp  446  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0056  23S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 2783 bp  442  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0062  23S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 2783 bp  442  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>