More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_R0074 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  Gs23SA  23S ribosomal RNA  83.37 
 
 
2958 bp  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  83.37 
 
 
2958 bp  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SA  23S ribosomal RNA  85.07 
 
 
2902 bp  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145616  hitchhiker  0.000134511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SB  23S ribosomal RNA  85.07 
 
 
2902 bp  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  hitchhiker  0.000114916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SC  23S ribosomal RNA  85.07 
 
 
2902 bp  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0640928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SD  23S ribosomal RNA  85.07 
 
 
2902 bp  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507419  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SE  23S ribosomal RNA  85.07 
 
 
2902 bp  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564865  normal  0.184682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SF  23S ribosomal RNA  85.07 
 
 
2902 bp  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SG  23S ribosomal RNA  85.07 
 
 
2902 bp  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SA  23S ribosomal RNA  84.88 
 
 
2904 bp  694    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SB  23S ribosomal RNA  84.88 
 
 
2904 bp  694    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352152  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r02  23S ribosomal RNA  87.49 
 
 
2908 bp  1473    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r05  23S ribosomal RNA  87.49 
 
 
2908 bp  1473    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.346302  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAr02  23S ribosomal RNA  88.05 
 
 
2809 bp  1441    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.722824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0048  23S ribosomal RNA  83.53 
 
 
2811 bp  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0016  23S ribosomal RNA  83.53 
 
 
2811 bp  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629398  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62060  23S ribosomal RNA  85.29 
 
 
2891 bp  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0546487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0037  23S ribosomal RNA  84.68 
 
 
2774 bp  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0010  23S ribosomal RNA  84.88 
 
 
2878 bp  678    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0250239  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0041  23S ribosomal RNA  84.68 
 
 
2774 bp  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0004  23S ribosomal RNA  84.68 
 
 
2774 bp  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174681  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08600  23S ribosomal RNA  85.18 
 
 
2891 bp  698    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000197684 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0066  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 
2918 bp  1219    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349554  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r02  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2903 bp  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r05  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2903 bp  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r08  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2903 bp  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r11  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2903 bp  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r14  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2903 bp  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA16  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2903 bp  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.048152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA49  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2903 bp  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832187  normal  0.473588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA7  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2903 bp  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.685402  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA71  23S ribosomal RNA  84.73 
 
 
2903 bp  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0658993  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA80  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2903 bp  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0495778  normal  0.0181156 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0016  23S ribosomal RNA  89.68 
 
 
2829 bp  2753    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.144056  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0013  23S ribosomal RNA  83.24 
 
 
2913 bp  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0027  23S ribosomal RNA  83.24 
 
 
2913 bp  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R15  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2892 bp  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28387  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R4  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2892 bp  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657154  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R44  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2892 bp  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R57  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2892 bp  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344499  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R78  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2892 bp  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0420771  normal  0.0126919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R91  23S ribosomal RNA  84.84 
 
 
2892 bp  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000653016  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4295  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 
2883 bp  1219    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4350  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 
2883 bp  1219    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4355  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 
2882 bp  1203    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0049  23S ribosomal RNA  83.77 
 
 
2956 bp  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0054  23S ribosomal RNA  83.77 
 
 
2956 bp  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  83.47 
 
 
2983 bp  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  83.37 
 
 
2983 bp  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0007  23S ribosomal RNA  86.54 
 
 
2758 bp  1140    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0021  23S ribosomal RNA  86.54 
 
 
2758 bp  1140    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0043  23S ribosomal RNA  86.54 
 
 
2758 bp  1140    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0061  23S ribosomal RNA  86.54 
 
 
2758 bp  1140    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0052  23S ribosomal RNA  90 
 
 
2830 bp  2853    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.121613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0050  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 
2783 bp  1076    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0056  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 
2783 bp  1076    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0062  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 
2783 bp  1076    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0048  23S ribosomal RNA  85.34 
 
 
3384 bp  1128    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.770601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0021  23S ribosomal RNA  89.49 
 
 
2847 bp  2744    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.727365  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0062  23S ribosomal RNA  89.53 
 
 
2847 bp  2752    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.451716  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0122  23S ribosomal RNA  85.32 
 
 
2893 bp  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0129  23S ribosomal RNA  85.32 
 
 
2893 bp  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0040  23S ribosomal RNA  85.61 
 
 
2747 bp  2042    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70880  23S ribosomal RNA  85.18 
 
 
2891 bp  698    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.560692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0020  23S ribosomal RNA  85.61 
 
 
2747 bp  2042    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.730998  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0012  23S ribosomal RNA  85.46 
 
 
2898 bp  720    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.31433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0007  23S ribosomal RNA  85.46 
 
 
2898 bp  720    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237096  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0058  23S ribosomal RNA  85.8 
 
 
2921 bp  1243    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0009  23S ribosomal RNA  90.29 
 
 
2832 bp  2888    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0067  23S ribosomal RNA  90.29 
 
 
2832 bp  2888    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0008  23S ribosomal RNA  84.79 
 
 
2904 bp  684    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0096662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0005  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 
2918 bp  1219    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0060  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 
2918 bp  1219    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0053  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 
2918 bp  1219    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0030  23S ribosomal RNA  84.79 
 
 
2904 bp  684    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000445054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0016  23S ribosomal RNA  89.64 
 
 
2863 bp  2746    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0083  23S ribosomal RNA  86.52 
 
 
2844 bp  1336    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0056  23S ribosomal RNA  86.52 
 
 
2844 bp  1336    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0066  23S ribosomal RNA  86.52 
 
 
2844 bp  1336    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47421  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0074  23S ribosomal RNA  86.52 
 
 
2844 bp  1336    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164783  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0005  23S ribosomal RNA  86.52 
 
 
2844 bp  1336    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0571128  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0045  23S ribosomal RNA  83.79 
 
 
2784 bp  1515    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724852  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0041  23S ribosomal RNA  88.34 
 
 
2875 bp  2508    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0051  23S ribosomal RNA  88.34 
 
 
2875 bp  2508    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0112  23S ribosomal RNA  85.32 
 
 
2893 bp  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0039  23S ribosomal RNA  85.8 
 
 
2921 bp  1243    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.409149 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0051  23S ribosomal RNA  85.8 
 
 
2921 bp  1243    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1083  23S ribosomal RNA  88.52 
 
 
2820 bp  1281    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.494767  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0261  23S ribosomal RNA  88.52 
 
 
2820 bp  1281    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0065  23S ribosomal RNA  85.32 
 
 
2893 bp  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.492717  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0066  23S ribosomal RNA  85.8 
 
 
2921 bp  1243    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324524  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0082  23S ribosomal RNA  83.72 
 
 
2940 bp  692    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0002  23S ribosomal RNA  85.32 
 
 
2893 bp  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.959463  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0005  23S ribosomal RNA  85.78 
 
 
2843 bp  1265    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0075  23S ribosomal RNA  83.72 
 
 
2940 bp  692    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.60998 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0024  23S ribosomal RNA  83.72 
 
 
2940 bp  692    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0008  23S ribosomal RNA  83.72 
 
 
2940 bp  692    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  hitchhiker  0.00128582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0031  23S ribosomal RNA  83.72 
 
 
2940 bp  692    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_r2  23S ribosomal RNA  85.78 
 
 
2818 bp  1265    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00999234  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0122  23S ribosomal RNA  84.22 
 
 
2893 bp  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.969635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>