299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_R0040 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_r00015  23S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 2904 bp  2307    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.373454  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0006  23S ribosomal RNA  86.58 
 
 		 2902 bp  2276    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0075  23S ribosomal RNA  86.58 
 
 		 2902 bp  2276    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.704928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0100  23S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 2903 bp  2319    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0111  23S ribosomal RNA  86.58 
 
 		 2902 bp  2276    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SA  23S ribosomal RNA  88.86 
 
 		 2902 bp  2926    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145616  hitchhiker  0.000134511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SB  23S ribosomal RNA  88.86 
 
 		 2902 bp  2926    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  hitchhiker  0.000114916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SC  23S ribosomal RNA  88.79 
 
 		 2902 bp  2910    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0640928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SD  23S ribosomal RNA  88.82 
 
 		 2902 bp  2918    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SE  23S ribosomal RNA  88.86 
 
 		 2902 bp  2920    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564865  normal  0.184682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SF  23S ribosomal RNA  88.82 
 
 		 2902 bp  2912    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SG  23S ribosomal RNA  88.86 
 
 		 2902 bp  2920    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SA  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2904 bp  2696    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SB  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2904 bp  2696    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r02  23S ribosomal RNA  90.75 
 
 		 2903 bp  1687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r05  23S ribosomal RNA  90.75 
 
 		 2903 bp  1687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r08  23S ribosomal RNA  90.75 
 
 		 2903 bp  1687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r11  23S ribosomal RNA  90.75 
 
 		 2903 bp  1687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r14  23S ribosomal RNA  90.68 
 
 		 2903 bp  1679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701415  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr02  23S ribosomal RNA  90.6 
 
 		 2861 bp  1459    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr05  23S ribosomal RNA  90.6 
 
 		 2861 bp  1459    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr08  23S ribosomal RNA  90.6 
 
 		 2861 bp  1459    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA16  23S ribosomal RNA  90.83 
 
 		 2903 bp  1697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.048152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA49  23S ribosomal RNA  90.76 
 
 		 2903 bp  1689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832187  normal  0.473588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA7  23S ribosomal RNA  90.76 
 
 		 2903 bp  1689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.685402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA71  23S ribosomal RNA  90.76 
 
 		 2903 bp  1689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0658993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA80  23S ribosomal RNA  90.76 
 
 		 2903 bp  1689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0495778  normal  0.0181156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0012  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2882 bp  1784    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0038  23S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 2899 bp  1780    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00487126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0013  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 2913 bp  2823    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0027  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 2913 bp  2823    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R15  23S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 2892 bp  2841    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R4  23S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 2892 bp  2841    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R44  23S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 2892 bp  2841    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R57  23S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 2892 bp  2841    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R78  23S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 2892 bp  2841    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0420771  normal  0.0126919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R91  23S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 2892 bp  2841    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000653016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0035  23S ribosomal RNA  86.67 
 
 		 2861 bp  2242    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.249297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0042  23S ribosomal RNA  86.67 
 
 		 2861 bp  2242    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0050  23S ribosomal RNA  86.67 
 
 		 2861 bp  2242    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0014  23S ribosomal RNA  86.99 
 
 		 2872 bp  2593    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0042  23S ribosomal RNA  86.99 
 
 		 2872 bp  2593    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 2897 bp  2522    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  87.52 
 
 		 2897 bp  2514    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  86.85 
 
 		 2897 bp  2520    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 2898 bp  2512    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  87.52 
 
 		 2897 bp  2514    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0156  23S ribosomal RNA  84.23 
 
 		 2902 bp  1725    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0507  23S ribosomal RNA  84.23 
 
 		 2902 bp  1725    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.157689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0002  23S ribosomal RNA  87.4 
 
 		 2893 bp  1463    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.492003  hitchhiker  0.00473622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0010  23S ribosomal RNA  87.47 
 
 		 2893 bp  1471    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150973  normal  0.511936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0135  23S ribosomal RNA  87.47 
 
 		 2893 bp  1471    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  hitchhiker  0.00197416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0142  23S ribosomal RNA  87.47 
 
 		 2893 bp  1471    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.080759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0010  23S ribosomal RNA  87.4 
 
 		 2893 bp  1463    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0173103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0023  23S ribosomal RNA  87.4 
 
 		 2893 bp  1463    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00167736  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0140  23S ribosomal RNA  87.4 
 
 		 2893 bp  1463    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0007  23S ribosomal RNA  89.79 
 
 		 2898 bp  3259    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0012  23S ribosomal RNA  89.86 
 
 		 2898 bp  3275    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08600  23S ribosomal RNA  90.69 
 
 		 2891 bp  1667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55631  23S ribosomal RNA  89.96 
 
 		 2884 bp  1564    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62060  23S ribosomal RNA  90.62 
 
 		 2891 bp  1659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0546487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70880  23S ribosomal RNA  90.69 
 
 		 2891 bp  1667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.560692 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0002  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2895 bp  1461    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0010  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2895 bp  1461    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0017  23S ribosomal RNA  87.46 
 
 		 2895 bp  1469    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000617374 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0072  23S ribosomal RNA  87.46 
 
 		 2895 bp  1469    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.130821  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0119  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2895 bp  1461    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0129  23S ribosomal RNA  87.39 
 
 		 2895 bp  1461    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0139  23S ribosomal RNA  87.46 
 
 		 2895 bp  1469    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0002  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 2914 bp  2194    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0007  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2914 bp  2179    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242783  hitchhiker  0.00573728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0015  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 2914 bp  2194    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631469  normal  0.115726 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0020  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 2914 bp  2194    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.879348  normal  0.651924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0025  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 2914 bp  2194    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278632  unclonable  0.0000171921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0053  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 2914 bp  2194    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0111  23S ribosomal RNA  85.64 
 
 		 2914 bp  2202    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0131  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 2914 bp  2194    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0004  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 2892 bp  2319    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.09917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0008  23S ribosomal RNA  86.23 
 
 		 2892 bp  2343    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0016  23S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 2892 bp  2351    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0033  23S ribosomal RNA  86.2 
 
 		 2892 bp  2335    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0044  23S ribosomal RNA  86.16 
 
 		 2892 bp  2327    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0756824 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0060  23S ribosomal RNA  86.23 
 
 		 2892 bp  2343    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.799594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0090  23S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 2892 bp  2351    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0102  23S ribosomal RNA  86.23 
 
 		 2892 bp  2343    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0105  23S ribosomal RNA  86.2 
 
 		 2892 bp  2335    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0109  23S ribosomal RNA  86.2 
 
 		 2892 bp  2335    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.147654 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0008  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 		 2904 bp  2863    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0096662  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0030  23S ribosomal RNA  88.19 
 
 		 2904 bp  2847    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000445054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0004  23S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 2893 bp  2123    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.194037 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0010  23S ribosomal RNA  85.44 
 
 		 2893 bp  2115    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636989 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0082  23S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 2893 bp  2123    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0103  23S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 2893 bp  2123    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0608054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0110  23S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 2893 bp  2123    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0115  23S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 2893 bp  2123    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.18423  hitchhiker  0.000445098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0121  23S ribosomal RNA  85.44 
 
 		 2893 bp  2115    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0442747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0124  23S ribosomal RNA  85.44 
 
 		 2893 bp  2115    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.303043 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0009  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2913 bp  2137    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0580735 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0101  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2913 bp  2137    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683549  decreased coverage  0.00714849 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0002  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2893 bp  1459    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.959463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>