More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0020 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0020  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
146 aa  289  7e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0278032  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0956  50S ribosomal protein L11  62.5 
 
 
147 aa  183  7e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0165  50S ribosomal protein L11  61.38 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  38.73 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  40.85 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  39.16 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0521  ribosomal protein L11  39.29 
 
 
144 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  39.44 
 
 
142 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  38.03 
 
 
141 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  39.44 
 
 
144 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  39.71 
 
 
141 aa  104  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  38.03 
 
 
141 aa  103  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  38.03 
 
 
142 aa  103  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  39.16 
 
 
142 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 
142 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1956  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
144 aa  103  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2563  50S ribosomal protein L11  37.76 
 
 
143 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  39.29 
 
 
141 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  43.17 
 
 
141 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0567  50S ribosomal protein L11  39.13 
 
 
142 aa  102  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000313352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  37.68 
 
 
142 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  39.16 
 
 
144 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  38.3 
 
 
141 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  37.32 
 
 
141 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  40.14 
 
 
141 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  37.41 
 
 
140 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  37.5 
 
 
143 aa  100  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  37.32 
 
 
141 aa  100  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  35.71 
 
 
145 aa  100  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  35 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  38.57 
 
 
142 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  37.32 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  37.32 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  40 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  39.29 
 
 
140 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  37.14 
 
 
142 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  36.17 
 
 
140 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  37.5 
 
 
144 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  33.1 
 
 
143 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  36.43 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2699  50S ribosomal protein L11  38.73 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  37.14 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  42.14 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  36.76 
 
 
142 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  36.76 
 
 
142 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  37.14 
 
 
142 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1527  50S ribosomal protein L11  36.62 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  36.76 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  36.76 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  38.24 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  35.66 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  35.51 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  36.76 
 
 
142 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2725  50S ribosomal protein L11  36.62 
 
 
142 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.053271  normal  0.344751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  38.81 
 
 
143 aa  96.7  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  35.92 
 
 
141 aa  96.7  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  38.13 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  34.51 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  34.51 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  32.86 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0349  ribosomal protein L11  38.03 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00040646  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2275  50S ribosomal protein L11  38.67 
 
 
148 aa  95.9  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1588  50S ribosomal protein L11  38.67 
 
 
148 aa  95.9  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  33.8 
 
 
141 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2363  50S ribosomal protein L11  38.67 
 
 
148 aa  95.9  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  38.13 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  38.13 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0974  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0169903 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  38.85 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  34.51 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  36.43 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0682  ribosomal protein L11  39.16 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000210281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  36.43 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  37.88 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  34.29 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  34.27 
 
 
142 aa  94.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3871  ribosomal protein L11  40.71 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1943  50S ribosomal protein L11  36.88 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0464106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  37.32 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  37.14 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  38.85 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2225  50S ribosomal protein L11  38.67 
 
 
148 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901746 
 
 
-
 
NC_004310  BR1248  50S ribosomal protein L11  36.17 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208102  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  35.92 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1209  50S ribosomal protein L11  36.17 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  33.8 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  36.03 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  37.68 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  37.93 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  33.1 
 
 
141 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  35.71 
 
 
141 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  36.76 
 
 
140 aa  94  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  36.69 
 
 
143 aa  94  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  37.41 
 
 
143 aa  93.6  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  35.71 
 
 
142 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0633  50S ribosomal protein L11  38.03 
 
 
150 aa  93.6  7e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00304315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1320  50S ribosomal protein L11  38.03 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.458077  normal  0.354215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  37.41 
 
 
140 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  38.13 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1806  50S ribosomal protein L11  33.1 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.785581  normal  0.199785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>