More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0956 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0956  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
147 aa  292  1e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0165  50S ribosomal protein L11  95.21 
 
 
147 aa  280  4.0000000000000003e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0020  50S ribosomal protein L11  62.5 
 
 
146 aa  183  7e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0278032  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0521  ribosomal protein L11  48.57 
 
 
144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2699  50S ribosomal protein L11  43.15 
 
 
142 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  45.32 
 
 
142 aa  126  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  41.1 
 
 
141 aa  124  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  43.84 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  44.52 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  45.21 
 
 
141 aa  123  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1527  50S ribosomal protein L11  43.15 
 
 
142 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1956  50S ribosomal protein L11  46.26 
 
 
144 aa  122  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  43.15 
 
 
142 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  44.14 
 
 
142 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  43.06 
 
 
141 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  42.76 
 
 
140 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  43.75 
 
 
142 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  43.06 
 
 
142 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  41.78 
 
 
141 aa  121  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  43.15 
 
 
142 aa  120  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  42.36 
 
 
141 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  42.47 
 
 
141 aa  120  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  43.84 
 
 
141 aa  120  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  43.15 
 
 
141 aa  120  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  40.97 
 
 
141 aa  119  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  43.06 
 
 
142 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  41.78 
 
 
141 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  44.29 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2425  50S ribosomal protein L11  44.29 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0323848  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  41.78 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  44.52 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  44.14 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  44.12 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  40.97 
 
 
142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  46.32 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  42.36 
 
 
141 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  39.73 
 
 
141 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  39.73 
 
 
141 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2563  50S ribosomal protein L11  41.78 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  43.15 
 
 
142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  42.65 
 
 
143 aa  117  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  40 
 
 
145 aa  117  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  40 
 
 
142 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  40.97 
 
 
141 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  44.52 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  41.91 
 
 
143 aa  115  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  39.73 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  42.65 
 
 
142 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  41.3 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  40.44 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  42.36 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  44.44 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  44.44 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  44.44 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  44.44 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  43.48 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  44.44 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  44.44 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1588  50S ribosomal protein L11  40.14 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  44.44 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  42.36 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  42.36 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2275  50S ribosomal protein L11  40.14 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  42.14 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  41.55 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  41.18 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2363  50S ribosomal protein L11  40.14 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  44.44 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  45.99 
 
 
143 aa  115  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  43.75 
 
 
143 aa  114  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  41.18 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  41.1 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  42.65 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  41.18 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  40.71 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  44.12 
 
 
140 aa  114  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  43.66 
 
 
148 aa  114  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  43.45 
 
 
143 aa  114  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  36.96 
 
 
143 aa  114  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  45.59 
 
 
140 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  45.59 
 
 
140 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  41.91 
 
 
143 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1209  50S ribosomal protein L11  42.76 
 
 
142 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2225  50S ribosomal protein L11  40.14 
 
 
148 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  41.91 
 
 
143 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  41.18 
 
 
142 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3360  50S ribosomal protein L11  41.06 
 
 
149 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711541  normal  0.0993173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>