More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1527 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1527  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  96.48 
 
 		 142 aa  283  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  94.33 
 
 		 142 aa  278  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  93.57 
 
 		 142 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  94.29 
 
 		 142 aa  273  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  92.14 
 
 		 142 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  90.78 
 
 		 142 aa  270  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3864  50S ribosomal protein L11  76.43 
 
 		 142 aa  230  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.094811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1343  50S ribosomal protein L11  76.06 
 
 		 142 aa  227  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0774434  normal  0.0441915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  75.71 
 
 		 142 aa  225  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3360  50S ribosomal protein L11  74.15 
 
 		 149 aa  224  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711541  normal  0.0993173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2725  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 		 142 aa  221  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.053271  normal  0.344751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1895  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 149 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00848778  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1248  50S ribosomal protein L11  74.29 
 
 		 142 aa  217  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3844  50S ribosomal protein L11  70.75 
 
 		 149 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1209  50S ribosomal protein L11  73.57 
 
 		 142 aa  217  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3998  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 		 149 aa  215  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.748509  normal  0.915544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4479  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 		 149 aa  215  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4367  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 		 149 aa  215  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0366  50S ribosomal protein L11  69.39 
 
 		 149 aa  215  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.556831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2699  50S ribosomal protein L11  73.94 
 
 		 142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1943  50S ribosomal protein L11  72.14 
 
 		 142 aa  213  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0464106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0974  50S ribosomal protein L11  72.86 
 
 		 142 aa  213  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0169903 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1819  50S ribosomal protein L11  74.47 
 
 		 143 aa  210  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.674274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1418  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 143 aa  207  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.816838  normal  0.409457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1320  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 143 aa  207  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.458077  normal  0.354215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2563  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 143 aa  204  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1442  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0567  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000313352  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1806  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.785581  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0836  50S ribosomal protein L11P  67.38 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00174211  normal  0.0898369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0260  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  201  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0833  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 143 aa  199  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.714386  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0229  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 141 aa  199  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0737159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4435  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0743  50S ribosomal protein L11  64.19 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0168765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1956  50S ribosomal protein L11  64.34 
 
 		 144 aa  191  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3864  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000881502  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 140 aa  190  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  189  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  189  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  189  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  189  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  189  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  189  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  189  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  189  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  65 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2956  50S ribosomal protein L11  64.34 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0664749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0169  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000273225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0584  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  187  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  63.57 
 
 		 143 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  185  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3644  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0202  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000393914  hitchhiker  0.0000945283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0173  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4701  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000419074  hitchhiker  0.00000427936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2260  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44071  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4328  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000353515  hitchhiker  0.00000000170841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0147  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000977469  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4391  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>