99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1571 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1571  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 		 320 aa  672    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  hitchhiker  0.000158628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1139  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  36.53 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0577692 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  26.43 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  27.12 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  26.11 
 
 		 461 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  26.11 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  26.11 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  25.65 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  24.07 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  24.91 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1902  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.04 
 
 		 880 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  24.63 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  24.72 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  24.63 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  24.07 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.08 
 
 		 798 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  24.44 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.54 
 
 		 771 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.83 
 
 		 814 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  23.23 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  24.85 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.57 
 
 		 791 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.7 
 
 		 818 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.07 
 
 		 789 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  25.45 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  23.05 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  21.35 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  22.83 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.61 
 
 		 757 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.18 
 
 		 794 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 		 808 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  22.96 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  22.83 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.76 
 
 		 773 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.35 
 
 		 746 aa  52.8  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  22.18 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  25 
 
 		 872 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  22.18 
 
 		 454 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  24.89 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.1 
 
 		 811 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.32 
 
 		 761 aa  49.3  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.51 
 
 		 709 aa  49.3  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 		 453 aa  49.7  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1779  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.21 
 
 		 762 aa  49.3  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  23.19 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  22.77 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.61 
 
 		 797 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0132  ComEC/Rec2-related protein  30.94 
 
 		 979 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.807661  normal  0.0603201 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.97 
 
 		 786 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.38 
 
 		 750 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  20 
 
 		 502 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.24 
 
 		 815 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.06 
 
 		 809 aa  46.2  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  32.98 
 
 		 819 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1798  ComEC/Rec2-related protein  27.17 
 
 		 937 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1573  beta-lactamase domain protein  24.61 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000229166  decreased coverage  0.000000804561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.49 
 
 		 766 aa  46.2  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  33.33 
 
 		 773 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.91 
 
 		 773 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 		 654 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1471  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.69 
 
 		 856 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.300879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0899  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.16 
 
 		 798 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383263  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  31.01 
 
 		 738 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 		 773 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1693  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.69 
 
 		 842 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.891985  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  21.93 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.25 
 
 		 839 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4358  hypothetical protein  25.21 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0722174  normal  0.346082 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2198  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.69 
 
 		 856 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3120  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.69 
 
 		 856 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  30.47 
 
 		 806 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.99 
 
 		 778 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2581  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.69 
 
 		 856 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2636  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.69 
 
 		 856 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0667077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.91 
 
 		 773 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.21 
 
 		 796 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.94 
 
 		 845 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.47 
 
 		 777 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.53 
 
 		 745 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2715  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.69 
 
 		 842 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  20.82 
 
 		 737 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.4 
 
 		 773 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  20.96 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 		 772 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 		 772 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.84 
 
 		 801 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.35 
 
 		 770 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.32 
 
 		 806 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>