59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1139 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1139  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 		 336 aa  706    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0577692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1571  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  36.3 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  hitchhiker  0.000158628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1902  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.9 
 
 		 880 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  24.37 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  24.37 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  24.37 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  24.43 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.95 
 
 		 818 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  24.27 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  22.71 
 
 		 872 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  23.56 
 
 		 454 aa  59.3  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.46 
 
 		 840 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  24.32 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1570  hypothetical protein  23.97 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  unclonable  0.0000135434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0132  ComEC/Rec2-related protein  26.05 
 
 		 979 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.807661  normal  0.0603201 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  23.75 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  23.46 
 
 		 291 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.74 
 
 		 801 aa  50.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  22.68 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  25.26 
 
 		 443 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.37 
 
 		 802 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1779  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.72 
 
 		 762 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.4 
 
 		 773 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.4 
 
 		 773 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  22.78 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl369  DNA uptake protein  35.14 
 
 		 607 aa  48.1  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  5.399e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  25.84 
 
 		 795 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 451 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  20.38 
 
 		 451 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  21.24 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  23.51 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0319  hypothetical protein  27.43 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  22.41 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  21.24 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.28 
 
 		 795 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.48 
 
 		 773 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  24.07 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.48 
 
 		 773 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2803  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.64 
 
 		 769 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  22.87 
 
 		 735 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.3 
 
 		 749 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.08 
 
 		 796 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  22.87 
 
 		 735 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.47 
 
 		 785 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1798  ComEC/Rec2-related protein  24.2 
 
 		 937 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0828  metallo-beta-lactamase superfamily protein, putative  32.86 
 
 		 688 aa  43.9  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2581  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.54 
 
 		 856 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  24.06 
 
 		 888 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.44 
 
 		 773 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.4 
 
 		 780 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.38 
 
 		 839 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  22.92 
 
 		 773 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.54 
 
 		 845 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.29 
 
 		 948 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2129  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.79 
 
 		 829 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326593  normal  0.0900672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0623  beta-lactamase domain protein  23.56 
 
 		 417 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>