15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0319 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0319  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  802    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2605  hypothetical protein  50.76 
 
 		 397 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3041  hypothetical protein  50.51 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2741  hypothetical protein  50.51 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1261  hypothetical protein  50.57 
 
 		 389 aa  306  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.536599  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0207  cobyric acid synthase CobQ  42.49 
 
 		 406 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2871  hypothetical protein  47.35 
 
 		 292 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3184  cobyric acid synthase CobQ  35.83 
 
 		 380 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.999187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0664  hypothetical protein  29.23 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4360  hypothetical protein  25.3 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2870  hypothetical protein  53.41 
 
 		 90 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1139  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  27.43 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0577692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.86 
 
 		 761 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.62 
 
 		 840 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>