30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1185 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  90.21 
 
 
623 aa  1149    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  100 
 
 
616 aa  1263    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  88.65 
 
 
619 aa  1134    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  68.41 
 
 
615 aa  881    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  45.35 
 
 
625 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  41.16 
 
 
632 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  41.16 
 
 
629 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  39.94 
 
 
642 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  38.95 
 
 
671 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  38.95 
 
 
689 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  38.24 
 
 
637 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  38.54 
 
 
670 aa  391  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  38.52 
 
 
672 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  37.98 
 
 
607 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  35.32 
 
 
618 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  33.97 
 
 
620 aa  313  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  33.08 
 
 
631 aa  287  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  30 
 
 
564 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  30.48 
 
 
580 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  30.4 
 
 
641 aa  246  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  30.42 
 
 
635 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  41.15 
 
 
276 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  30.46 
 
 
600 aa  170  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  27.57 
 
 
607 aa  167  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  29.08 
 
 
644 aa  63.9  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  28.76 
 
 
620 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  30.53 
 
 
754 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.717395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2531  hypothetical protein  24.88 
 
 
743 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2886  hypothetical protein  30 
 
 
741 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0221  hypothetical protein  30 
 
 
741 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>