30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1414 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  100 
 
 
635 aa  1313    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  32.98 
 
 
641 aa  323  6e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  31.85 
 
 
631 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  29.68 
 
 
615 aa  238  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  30.42 
 
 
616 aa  235  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  30.21 
 
 
623 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  30.53 
 
 
625 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  29.17 
 
 
620 aa  223  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  31.46 
 
 
580 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  29.41 
 
 
619 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  29.46 
 
 
618 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  30.85 
 
 
642 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  28.16 
 
 
564 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  26.63 
 
 
607 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  28.33 
 
 
600 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  29.32 
 
 
632 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  28.87 
 
 
637 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  27.16 
 
 
629 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  30 
 
 
670 aa  183  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  30.75 
 
 
671 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  30.75 
 
 
689 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  28.49 
 
 
672 aa  180  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  27.59 
 
 
607 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  36.08 
 
 
276 aa  144  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  23.4 
 
 
754 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.717395 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2886  hypothetical protein  22.56 
 
 
741 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0221  hypothetical protein  22.56 
 
 
741 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2531  hypothetical protein  26.19 
 
 
743 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  32.56 
 
 
644 aa  55.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  27.08 
 
 
620 aa  51.2  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>