28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0227 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  73.58 
 
 
620 aa  941    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  100 
 
 
618 aa  1274    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  35.94 
 
 
619 aa  341  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  35.32 
 
 
616 aa  325  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  34.71 
 
 
615 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  35.76 
 
 
623 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  33.85 
 
 
625 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  34.32 
 
 
607 aa  289  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  32.97 
 
 
637 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  33.7 
 
 
632 aa  269  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  33.18 
 
 
642 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  30.39 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  27.51 
 
 
672 aa  231  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  29.66 
 
 
631 aa  229  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  29.43 
 
 
689 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  29.43 
 
 
671 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  29.09 
 
 
670 aa  221  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  29.46 
 
 
635 aa  217  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  28.74 
 
 
580 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  28.39 
 
 
564 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  28.16 
 
 
641 aa  211  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  29.14 
 
 
600 aa  154  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  36.11 
 
 
276 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  24.81 
 
 
607 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2531  hypothetical protein  22.44 
 
 
743 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  25.96 
 
 
620 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  26.36 
 
 
754 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.717395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  23.66 
 
 
644 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>