30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3851 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  67.21 
 
 
623 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  68.41 
 
 
616 aa  881    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  69.72 
 
 
619 aa  900    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1264    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  47.27 
 
 
625 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  42.37 
 
 
632 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  41.04 
 
 
629 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  40.48 
 
 
637 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  40.73 
 
 
642 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  38.59 
 
 
689 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  38.59 
 
 
671 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  38.19 
 
 
670 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  37.58 
 
 
672 aa  359  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  37.44 
 
 
607 aa  349  7e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  34.71 
 
 
618 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  34.53 
 
 
620 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  32.36 
 
 
564 aa  299  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  33.59 
 
 
631 aa  294  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  32.23 
 
 
580 aa  274  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  30.83 
 
 
641 aa  256  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  29.68 
 
 
635 aa  238  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  28.17 
 
 
607 aa  190  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  42.34 
 
 
276 aa  187  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  30.88 
 
 
600 aa  170  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  25.57 
 
 
644 aa  75.5  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  26.61 
 
 
620 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2886  hypothetical protein  26.58 
 
 
741 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0221  hypothetical protein  26.58 
 
 
741 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  28.68 
 
 
754 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.717395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2531  hypothetical protein  25.96 
 
 
743 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>